NLRC4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, NLR family, CARD domain containing 4, NLR family CARD domain containing 4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606831 MGI: 3036243 HomoloGene: 10924 GeneCards: NLRC4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
familial cold autoinflammatory syndrome 4, periodic fever-infantile enterocolitis-autoinflammatory syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleotide binding • protein homodimerization activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • magnesium ion binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • IPAF inflammasome complex • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • Піроптоз • inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • процес імунної системи • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • mitotic spindle assembly • regulation of signal transduction • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • detection of bacterium • activation of innate immune response • positive regulation of apoptotic process • inflammatory response • protein homooligomerization • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0097285 апоптоз • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of apoptotic process • вроджений імунітет |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001199138 NM_001199139 NM_001302504 NM_021209 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186067 NP_001186068 NP_001289433 NP_067032 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 32.22 – 32.27 Mb | Хр. 17: 74.73 – 74.77 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NLRC4 (англ. NLR family CARD domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 024 амінокислот, а молекулярна маса — 116 159[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNFIKDNSRA | | LIQRMGMTVI | | KQITDDLFVW | | NVLNREEVNI | | ICCEKVEQDA |
ARGIIHMILK | | KGSESCNLFL | | KSLKEWNYPL | | FQDLNGQSLF | | HQTSEGDLDD |
LAQDLKDLYH | | TPSFLNFYPL | | GEDIDIIFNL | | KSTFTEPVLW | | RKDQHHHRVE |
QLTLNGLLQA | | LQSPCIIEGE | | SGKGKSTLLQ | | RIAMLWGSGK | | CKALTKFKFV |
FFLRLSRAQG | | GLFETLCDQL | | LDIPGTIRKQ | | TFMAMLLKLR | | QRVLFLLDGY |
NEFKPQNCPE | | IEALIKENHR | | FKNMVIVTTT | | TECLRHIRQF | | GALTAEVGDM |
TEDSAQALIR | | EVLIKELAEG | | LLLQIQKSRC | | LRNLMKTPLF | | VVITCAIQMG |
ESEFHSHTQT | | TLFHTFYDLL | | IQKNKHKHKG | | VAASDFIRSL | | DHCGDLALEG |
VFSHKFDFEL | | QDVSSVNEDV | | LLTTGLLCKY | | TAQRFKPKYK | | FFHKSFQEYT |
AGRRLSSLLT | | SHEPEEVTKG | | NGYLQKMVSI | | SDITSTYSSL | | LRYTCGSSVE |
ATRAVMKHLA | | AVYQHGCLLG | | LSIAKRPLWR | | QESLQSVKNT | | TEQEILKAIN |
INSFVECGIH | | LYQESTSKSA | | LSQEFEAFFQ | | GKSLYINSGN | | IPDYLFDFFE |
HLPNCASALD | | FIKLDFYGGA | | MASWEKAAED | | TGGIHMEEAP | | ETYIPSRAVS |
LFFNWKQEFR | | TLEVTLRDFS | | KLNKQDIRYL | | GKIFSSATSL | | RLQIKRCAGV |
AGSLSLVLST | | CKNIYSLMVE | | ASPLTIEDER | | HITSVTNLKT | | LSIHDLQNQR |
LPGGLTDSLG | | NLKNLTKLIM | | DNIKMNEEDA | | IKLAEGLKNL | | KKMCLFHLTH |
LSDIGEGMDY | | IVKSLSSEPC | | DLEEIQLVSC | | CLSANAVKIL | | AQNLHNLVKL |
SILDLSENYL | | EKDGNEALHE | | LIDRMNVLEQ | | LTALMLPWGC | | DVQGSLSSLL |
KHLEEVPQLV | | KLGLKNWRLT | | DTEIRILGAF | | FGKNPLKNFQ | | QLNLAGNRVS |
SDGWLAFMGV | | FENLKQLVFF | | DFSTKEFLPD | | PALVRKLSQV | | LSKLTFLQEA |
RLVGWQFDDD | | DLSVITGAFK | | LVTA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- Damiano J.S., Stehlik C., Pio F., Godzik A., Reed J.C. (2001). CLAN, a novel human CED-4-like gene. Genomics. 75: 77—83. PMID 11472070 DOI:10.1006/geno.2001.6579
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Damiano J.S., Oliveira V., Welsh K., Reed J.C. (2004). Heterotypic interactions among NACHT domains: implications for regulation of innate immune responses. Biochem. J. 381: 213—219. PMID 15107016 DOI:10.1042/BJ20031506
- Kitamura A., Sasaki Y., Abe T., Kano H., Yasutomo K. (2014). An inherited mutation in NLRC4 causes autoinflammation in human and mice. J. Exp. Med. 211: 2385—2396. PMID 25385754 DOI:10.1084/jem.20141091
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NLRC4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16412 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9NPP4 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2012. Процитовано 29 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |