NLRP7

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KM6

Ідентифікатори

Символи

NLRP7, CLR19.4, HYDM, NALP7, NOD12, PAN7, PYPAF3, NLR family, pyrin domain containing 7, NLR family pyrin domain containing 7

Зовнішні ІД

OMIM: 609661 HomoloGene: 51401 GeneCards: NLRP7

Пов'язані генетичні захворювання

gestational trophoblastic neoplasm^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATP binding • nucleotide binding • aspartic-type endopeptidase inhibitor activity • interleukin-1 binding • caspase binding
Клітинна компонента	• компонент клітини
Біологічний процес	• negative regulation of endopeptidase activity • negative regulation of protein processing • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interleukin-1 • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • negative regulation of aspartic-type peptidase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


199713


н/д

Ensembl

ENSG00000276804 ENSG00000167634 ENSG00000278173 ENSG00000277179 ENSG00000274174
ENSG00000277776 ENSG00000277786 ENSG00000275483 ENSG00000277071 ENSG00000274571


н/д

UniProt


Q8WX94


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001127255 NM_139176 NM_206828 NM_001405531


н/д

RefSeq (білок)


NP_001120727 NP_631915 NP_996611


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 54.92 – 54.97 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

NLRP7 (англ. NLR family pyrin domain containing 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 980 амінокислот, а молекулярна маса — 111 807^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSPQLEWTL	QTLLEQLNED	ELKSFKSLLW	AFPLEDVLQK	TPWSEVEEAD
GKKLAEILVN	TSSENWIRNA	TVNILEEMNL	TELCKMAKAE	MMEDGQVQEI
DNPELGDAEE	DSELAKPGEK	EGWRNSMEKQ	SLVWKNTFWQ	GDIDNFHDDV
TLRNQRFIPF	LNPRTPRKLT	PYTVVLHGPA	GVGKTTLAKK	CMLDWTDCNL
SPTLRYAFYL	SCKELSRMGP	CSFAELISKD	WPELQDDIPS	ILAQAQRILF
VVDGLDELKV	PPGALIQDIC	GDWEKKKPVP	VLLGSLLKRK	MLPRAALLVT
TRPRALRDLQ	LLAQQPIYVR	VEGFLEEDRR	AYFLRHFGDE	DQAMRAFELM
RSNAALFQLG	SAPAVCWIVC	TTLKLQMEKG	EDPVPTCLTR	TGLFLRFLCS
RFPQGAQLRG	ALRTLSLLAA	QGLWAQMSVF	HREDLERLGV	QESDLRLFLD
GDILRQDRVS	KGCYSFIHLS	FQQFLTALFY	ALEKEEGEDR	DGHAWDIGDV
QKLLSGEERL	KNPDLIQVGH	FLFGLANEKR	AKELEATFGC	RMSPDIKQEL
LQCKAHLHAN	KPLSVTDLKE	VLGCLYESQE	EELAKVVVAP	FKEISIHLTN
TSEVMHCSFS	LKHCQDLQKL	SLQVAKGVFL	ENYMDFELDI	EFERCTYLTI
PNWARQDLRS	LRLWTDFCSL	FSSNSNLKFL	EVKQSFLSDS	SVRILCDHVT
RSTCHLQKVE	IKNVTPDTAY	RDFCLAFIGK	KTLTHLTLAG	HIEWERTMML
MLCDLLRNHK	CNLQYLRLGG	HCATPEQWAE	FFYVLKANQS	LKHLRLSANV
LLDEGAMLLY	KTMTRPKHFL	QMLSLENCRL	TEASCKDLAA	VLVVSKKLTH
LCLAKNPIGD	TGVKFLCEGL	SYPDCKLQTL	VLQQCSITKL	GCRYLSEALQ
EACSLTNLDL	SINQIARGLW	ILCQALENPN	CNLKHLRLKT	YETNLEIKKL
LEEVKEKNPK	LTIDCNASGA	TAPPCCDFFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95—104. PMID 12563287 DOI:10.1038/nrm1019
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Inohara N., Nunez G. (2003). NODs: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis. Nat. Rev. Immunol. 3: 371—382. PMID 12766759 DOI:10.1038/nri1086
Kinoshita T., Wang Y., Hasegawa M., Imamura R., Suda T. (2005). PYPAF3, a PYRIN-containing APAF-1-like protein, is a feedback regulator of caspase-1-dependent interleukin-1beta secretion. J. Biol. Chem. 280: 21720—21725. PMID 15817483 DOI:10.1074/jbc.M410057200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NLRP7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22947 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WX94 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2012. Процитовано 12 вересня 2017.