NOB1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

NOB1

Ідентифікатори

Символи

NOB1, ART-4, MST158, NOB1P, PSMD8BP1, MSTP158, NIN1/PSMD8 binding protein 1 homolog, NIN1 (RPN12) binding protein 1 homolog

Зовнішні ІД

OMIM: 613586 MGI: 1914869 HomoloGene: 31924 GeneCards: NOB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity
Клітинна компонента	• preribosome, small subunit precursor • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• maturation of SSU-rRNA • зір • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • rRNA processing • cleavage involved in rRNA processing • ribosomal small subunit biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


28987


67619

Ensembl


ENSG00000141101


ENSMUSG00000003848

UniProt


Q9ULX3


Q8BW10

RefSeq (мРНК)


NM_014062


NM_026277

RefSeq (білок)


NP_054781


NP_080553

Локус (UCSC)

Хр. 16: 69.74 – 69.75 Mb

Хр. 8: 108.14 – 108.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NOB1 (англ. NIN1/PSMD8 binding protein 1 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 46 675^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPVEHVVAD	AGAFLRHAAL	QDIGKNIYTI	REVVTEIRDK	ATRRRLAVLP
YELRFKEPLP	EYVRLVTEFS	KKTGDYPSLS	ATDIQVLALT	YQLEAEFVGV
SHLKQEPQKV	KVSSSIQHPE	TPLHISGFHL	PYKPKPPQET	EKGHSACEPE
NLEFSSFMFW	RNPLPNIDHE	LQELLIDRGE	DVPSEEEEEE	ENGFEDRKDD
SDDDGGGWIT	PSNIKQIQQE	LEQCDVPEDV	RVGCLTTDFA	MQNVLLQMGL
HVLAVNGMLI	REARSYILRC	HGCFKTTSDM	SRVFCSHCGN	KTLKKVSVTV
SDDGTLHMHF	SRNPKVLNPR	GLRYSLPTPK	GGKYAINPHL	TEDQRFPQLR
LSQKARQKTN	VFAPDYIAGV	SPFVENDISS	RSATLQVRDS	TLGAGRRRLN
PNASRKKFVK	KR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29540 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULX3 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.