NOP53

Ідентифікатори

Символи

NOP53, PICT-1, PICT1, GLTSCR2, glioma tumor suppressor candidate region gene 2, NOP53 ribosome biogenesis factor

Зовнішні ІД

OMIM: 605691 MGI: 2154441 HomoloGene: 44130 GeneCards: NOP53

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding • 5S rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • p53 binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • ядерце • гіалоплазма • fibrillar center • rDNA heterochromatin • нуклеоплазма
Біологічний процес	• ribosomal large subunit assembly • regulation of protein phosphorylation • protein stabilization • regulation of signal transduction by p53 class mediator • negative regulation of signal transduction by p53 class mediator • regulation of aerobic respiration • ribosomal large subunit export from nucleus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly • negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of apoptotic process • regulation of cell cycle • cellular response to hypoxia • protein localization to nucleolus • protein localization to nucleoplasm • cellular response to DNA damage stimulus • regulation of RIG-I signaling pathway • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I • positive regulation of protein K63-linked deubiquitination • ribosome biogenesis • rRNA processing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


29997


68077

Ensembl


ENSG00000105373


ENSMUSG00000041560

UniProt


Q9NZM5


Q8BK35

RefSeq (мРНК)


NM_015710


NM_133831

RefSeq (білок)


NP_056525


NP_598592

Локус (UCSC)

Хр. 19: 47.75 – 47.76 Mb

Хр. 7: 15.67 – 15.68 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NOP53 (англ. NOP53 ribosome biogenesis factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 54 389^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGGSGVGG	KRSSKSDADS	GFLGLRPTSV	DPALRRRRRG	PRNKKRGWRR
LAQEPLGLEV	DQFLEDVRLQ	ERTSGGLLSE	APNEKLFFVD	TGSKEKGLTK
KRTKVQKKSL	LLKKPLRVDL	ILENTSKVPA	PKDVLAHQVP	NAKKLRRKEQ
LWEKLAKQGE	LPREVRRAQA	RLLNPSATRA	KPGPQDTVER	PFYDLWASDN
PLDRPLVGQD	EFFLEQTKKK	GVKRPARLHT	KPSQAPAVEV	APAGASYNPS
FEDHQTLLSA	AHEVELQRQK	EAEKLERQLA	LPATEQAATQ	ESTFQELCEG
LLEESDGEGE	PGQGEGPEAG	DAEVCPTPAR	LATTEKKTEQ	QRRREKAVHR
LRVQQAALRA	ARLRHQELFR	LRGIKAQVAL	RLAELARRQR	RRQARREAEA
DKPRRLGRLK	YQAPDIDVQL	SSELTDSLRT	LKPEGNILRD	RFKSFQRRNM
IEPRERAKFK	RKYKVKLVEK	RAFREIQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Okahara F., Ikawa H., Kanaho Y., Maehama T. (2004). Regulation of PTEN phosphorylation and stability by a tumor suppressor candidate protein. J. Biol. Chem. 279: 45300—45303. PMID 15355975 DOI:10.1074/jbc.C400377200
Kalt I., Borodianskiy-Shteinberg T., Schachor A., Sarid R. (2010). GLTSCR2/PICT-1, a putative tumor suppressor gene product, induces the nucleolar targeting of the Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus KS-Bcl-2 protein. J. Virol. 84: 2935—2945. PMID 20042497 DOI:10.1128/JVI.00757-09
Kalt I., Levy A., Borodianskiy-Shteinberg T., Sarid R. (2012). Nucleolar localization of GLTSCR2/PICT-1 is mediated by multiple unique nucleolar localization sequences. PLoS ONE. 7: E30825—E30825. PMID 22292050 DOI:10.1371/journal.pone.0030825
Sloan K.E., Bohnsack M.T., Watkins N.J. (2013). The 5S RNP couples p53 homeostasis to ribosome biogenesis and nucleolar stress. Cell Rep. 5: 237—247. PMID 24120868 DOI:10.1016/j.celrep.2013.08.049
Maehama T., Kawahara K., Nishio M., Suzuki A., Hanada K. (2014). Nucleolar stress induces ubiquitination-independent proteasomal degradation of PICT1 protein. J. Biol. Chem. 289: 20802—20812. PMID 24923447 DOI:10.1074/jbc.M114.571893

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4333 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZM5 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.