NPLOC4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2PJH

Ідентифікатори

Символи

NPLOC4, NPL4, NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor

Зовнішні ІД

OMIM: 606590 MGI: 2679787 HomoloGene: 5403 GeneCards: NPLOC4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • nuclear outer membrane-endoplasmic reticulum membrane network • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • UFD1-NPL4 complex • нуклеоплазма • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex
Біологічний процес	• error-free translesion synthesis • retrograde protein transport, ER to cytosol • Golgi organization • ubiquitin-dependent ERAD pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55666


217365

Ensembl


ENSG00000182446


ENSMUSG00000039703

UniProt


Q8TAT6


P60670

RefSeq (мРНК)


NM_017921 NM_001369698


NM_001195023 NM_199469

RefSeq (білок)


NP_060391 NP_001356627 NP_060391.2


NP_001181952 NP_955763

Локус (UCSC)

Хр. 17: 81.56 – 81.65 Mb

Хр. 11: 120.27 – 120.33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NPLOC4 (англ. NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 608 амінокислот, а молекулярна маса — 68 120^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAESIIIRVQ	SPDGVKRITA	TKRETAATFL	KKVAKEFGFQ	NNGFSVYINR
NKTGEITASS	NKSLNLLKIK	HGDLLFLFPS	SLAGPSSEME	TSVPPGFKVF
GAPNVVEDEI	DQYLSKQDGK	IYRSRDPQLC	RHGPLGKCVH	CVPLEPFDED
YLNHLEPPVK	HMSFHAYIRK	LTGGADKGKF	VALENISCKI	KSGCEGHLPW
PNGICTKCQP	SAITLNRQKY	RHVDNIMFEN	HTVADRFLDF	WRKTGNQHFG
YLYGRYTEHK	DIPLGIRAEV	AAIYEPPQIG	TQNSLELLED	PKAEVVDEIA
AKLGLRKVGW	IFTDLVSEDT	RKGTVRYSRN	KDTYFLSSEE	CITAGDFQNK
HPNMCRLSPD	GHFGSKFVTA	VATGGPDNQV	HFEGYQVSNQ	CMALVRDECL
LPCKDAPELG	YAKESSSEQY	VPDVFYKDVD	KFGNEITQLA	RPLPVEYLII
DITTTFPKDP	VYTFSISQNP	FPIENRDVLG	ETQDFHSLAT	YLSQNTSSVF
LDTISDFHLL	LFLVTNEVMP	LQDSISLLLE	AVRTRNEELA	QTWKRSEQWA
TIEQLCSTVG	GQLPGLHEYG	AVGGSTHTAT	AAMWACQHCT	FMNQPGTGHC
EMCSLPRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18261 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TAT6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.