NPLOC4 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/26/Protein_NPLOC4_PDB_1nj3.png/250px-Protein_NPLOC4_PDB_1nj3.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NPLOC4, NPL4, NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606590 MGI: 2679787 HomoloGene: 5403 GeneCards: NPLOC4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • ubiquitin protein ligase binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear outer membrane-endoplasmic reticulum membrane network • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • UFD1-NPL4 complex • нуклеоплазма • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex |
---|
Біологічний процес | • error-free translesion synthesis • retrograde protein transport, ER to cytosol • Golgi organization • ubiquitin-dependent ERAD pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/25/PBB_GE_NPLOC4_217796_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_NPLOC4_217796_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_060391 NP_001356627 NP_060391.2 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 81.56 – 81.65 Mb | Хр. 11: 120.27 – 120.33 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NPLOC4 (англ. NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 608 амінокислот, а молекулярна маса — 68 120[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAESIIIRVQ | | SPDGVKRITA | | TKRETAATFL | | KKVAKEFGFQ | | NNGFSVYINR |
NKTGEITASS | | NKSLNLLKIK | | HGDLLFLFPS | | SLAGPSSEME | | TSVPPGFKVF |
GAPNVVEDEI | | DQYLSKQDGK | | IYRSRDPQLC | | RHGPLGKCVH | | CVPLEPFDED |
YLNHLEPPVK | | HMSFHAYIRK | | LTGGADKGKF | | VALENISCKI | | KSGCEGHLPW |
PNGICTKCQP | | SAITLNRQKY | | RHVDNIMFEN | | HTVADRFLDF | | WRKTGNQHFG |
YLYGRYTEHK | | DIPLGIRAEV | | AAIYEPPQIG | | TQNSLELLED | | PKAEVVDEIA |
AKLGLRKVGW | | IFTDLVSEDT | | RKGTVRYSRN | | KDTYFLSSEE | | CITAGDFQNK |
HPNMCRLSPD | | GHFGSKFVTA | | VATGGPDNQV | | HFEGYQVSNQ | | CMALVRDECL |
LPCKDAPELG | | YAKESSSEQY | | VPDVFYKDVD | | KFGNEITQLA | | RPLPVEYLII |
DITTTFPKDP | | VYTFSISQNP | | FPIENRDVLG | | ETQDFHSLAT | | YLSQNTSSVF |
LDTISDFHLL | | LFLVTNEVMP | | LQDSISLLLE | | AVRTRNEELA | | QTWKRSEQWA |
TIEQLCSTVG | | GQLPGLHEYG | | AVGGSTHTAT | | AAMWACQHCT | | FMNQPGTGHC |
EMCSLPRT |
Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18261 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8TAT6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |