NR0B2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c5/Protein_NR0B2_PDB_1YUC.png/250px-Protein_NR0B2_PDB_1YUC.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1YUC, 2Q3Y, 2Z4J, 4DOR, 4ONI | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NR0B2, SHP, SHP1, nuclear receptor subfamily 0 group B member 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604630 MGI: 1346344 HomoloGene: 8030 GeneCards: NR0B2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • protein homodimerization activity • protein domain specific binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding • transcription factor binding • retinoic acid receptor binding • peroxisome proliferator activated receptor binding • retinoid X receptor binding • thyroid hormone receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • Сигнальний шлях Notch • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to glucose • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • animal organ regeneration • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of insulin secretion • steroid hormone mediated signaling pathway • циркадний ритм • circadian regulation of gene expression • ритмічний процес |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/5e/PBB_GE_NR0B2_206410_at_fs.png/250px-PBB_GE_NR0B2_206410_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 26.91 – 26.91 Mb | Хр. 4: 133.28 – 133.28 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NR0B2 (англ. Nuclear receptor subfamily 0 group B member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 257 амінокислот, а молекулярна маса — 28 058[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSTSQPGACP | | CQGAASRPAI | | LYALLSSSLK | | AVPRPRSRCL | | CRQHRPVQLC |
APHRTCREAL | | DVLAKTVAFL | | RNLPSFWQLP | | PQDQRRLLQG | | CWGPLFLLGL |
AQDAVTFEVA | | EAPVPSILKK | | ILLEEPSSSG | | GSGQLPDRPQ | | PSLAAVQWLQ |
CCLESFWSLE | | LSPKEYACLK | | GTILFNPDVP | | GLQAASHIGH | | LQQEAHWVLC |
EVLEPWCPAA | | QGRLTRVLLT | | ASTLKSIPTS | | LLGDLFFRPI | | IGDVDIAGLL |
GDMLLLR |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Seol W., Choi H.-S., Moore D.D. (1996). An orphan nuclear hormone receptor that lacks a DNA binding domain and heterodimerizes with other receptors. Science. 272: 1336—1339. PMID 8650544 DOI:10.1126/science.272.5266.1336
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7961 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q15466 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|