ONECUT1

ONECUT1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1S7E

Ідентифікатори
Символи ONECUT1, HNF-6, HNF6, HNF6A, one cut homeobox 1
Зовнішні ІД OMIM: 604164 MGI: 1196423 HomoloGene: 3309 GeneCards: ONECUT1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
epithelial cell development
диференціація клітин
cell fate commitment
endoderm development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of cell migration
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
anatomical structure morphogenesis
negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
spleen development
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
regulation of cell-matrix adhesion
glucose metabolic process
pancreas development
liver development
B cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
organism system development
endocrine pancreas development
cilium assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3175
15379
Ensembl
ENSG00000169856
ENSMUSG00000043013
UniProt
Q9UBC0
O08755
RefSeq (мРНК)
NM_004498
NM_008262
RefSeq (білок)
NP_004489
NP_032288
Локус (UCSC) Хр. 15: 52.76 – 52.79 Mb Хр. 9: 74.77 – 74.8 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ONECUT1 (англ. One cut homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 51 023[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNAQLTMEAIGELHGVSHEPVPAPADLLGGSPHARSSVAHRGSHLPPAHP
RSMGMASLLDGGSGGGDYHHHHRAPEHSLAGPLHPTMTMACETPPGMSMP
TTYTTLTPLQPLPPISTVSDKFPHHHHHHHHHHHPHHHQRLAGNVSGSFT
LMRDERGLASMNNLYTPYHKDVAGMGQSLSPLSSSGLGSIHNSQQGLPHY
AHPGAAMPTDKMLTPNGFEAHHPAMLGRHGEQHLTPTSAGMVPINGLPPH
HPHAHLNAQGHGQLLGTAREPNPSVTGAQVSNGSNSGQMEEINTKEVAQR
ITTELKRYSIPQAIFAQRVLCRSQGTLSDLLRNPKPWSKLKSGRETFRRM
WKWLQEPEFQRMSALRLAACKRKEQEHGKDRGNTPKKPRLVFTDVQRRTL
HAIFKENKRPSKELQITISQQLGLELSTVSNFFMNARRRSLDKWQDEGSS
NSGNSSSSSSTCTKA

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8138 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9UBC0 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 15
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.