PARD6A

PARD6A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1WMH

Ідентифікатори
Символи PARD6A, PAR-6A, PAR6, PAR6C, PAR6alpha, TAX40, TIP-40, par-6 family cell polarity regulator alpha
Зовнішні ІД OMIM: 607484 MGI: 1927223 HomoloGene: 9661 GeneCards: PARD6A
Онтологія гена
Молекулярна функція

transcription factor binding
GTP-dependent protein binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein kinase C binding

Клітинна компонента

гіалоплазма
cell projection
мембрана
bicellular tight junction
ruffle
клітинна мембрана
cell cortex
клітинне ядро
цитоплазма
центросома
центр організації мікротрубочок
цитоскелет
міжклітинні контакти
centriolar satellite
GO:0009327 protein-containing complex
apical plasma membrane

Біологічний процес

GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation
поділ клітини
cell-cell junction maintenance
bicellular tight junction assembly
клітинний цикл
GO:0022415 viral process
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway
positive regulation of protein localization to centrosome
centrosome cycle
establishment or maintenance of cell polarity
regulation of cellular localization
positive regulation of protein secretion

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
50855
56513
Ensembl
ENSG00000102981
ENSMUSG00000005699
UniProt
Q9NPB6
Q9Z101
RefSeq (мРНК)
NM_001037281
NM_016948
NM_001047435
NM_001047436
NM_001286344
NM_001286345
NM_019695
RefSeq (білок)
NP_001032358
NP_058644
NP_001040900
NP_001040901
NP_001273273
NP_001273274
NP_062669
Локус (UCSC) Хр. 16: 67.66 – 67.66 Mb Хр. 8: 106.43 – 106.43 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PARD6A (англ. Par-6 family cell polarity regulator alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 37 388[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MARPQRTPARSPDSIVEVKSKFDAEFRRFALPRASVSGFQEFSRLLRAVH
QIPGLDVLLGYTDAHGDLLPLTNDDSLHRALASGPPPLRLLVQKRAEADS
SGLAFASNSLQRRKKGLLLRPVAPLRTRPPLLISLPQDFRQVSSVIDVDL
LPETHRRVRLHKHGSDRPLGFYIRDGMSVRVAPQGLERVPGIFISRLVRG
GLAESTGLLAVSDEILEVNGIEVAGKTLDQVTDMMVANSHNLIVTVKPAN
QRNNVVRGASGRLTGPPSAGPGPAEPDSDDDSSDLVIENRQPPSSNGLSQ
GPPCWDLHPGCRHPGTRSSLPSLDDQEQASSGWGSRIRGDGSGFSL

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, щільних контактах.

Література

  • Qiu R.-G., Abo A., Martin G.S. (2000). A human homolog of the Caenorhabditis elegans polarity determinant Par-6 links Rac and Cdc42 to PKC-zeta signaling and cell transformation. Curr. Biol. 10: 697—707. PMID 10873802 DOI:10.1016/S0960-9822(00)00535-2
  • Joberty G., Petersen C., Gao L., Macara I.G. (2000). The cell-polarity protein Par6 links Par3 and atypical protein kinase C to Cdc42. Nat. Cell Biol. 2: 531—539. PMID 10934474 DOI:10.1038/35019573
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Rousset R., Fabre S., Desbois C., Bantignies F., Jalinot P. (1998). The C-terminus of the HTLV-1 Tax oncoprotein mediates interaction with the PDZ domain of cellular proteins. Oncogene. 16: 643—654. PMID 9482110 DOI:10.1038/sj.onc.1201567
  • Hurd T.W., Gao L., Roh M.H., Macara I.G., Margolis B. (2003). Direct interaction of two polarity complexes implicated in epithelial tight junction assembly. Nat. Cell Biol. 5: 137—142. PMID 12545177 DOI:10.1038/ncb923
  • Liu X.F., Ishida H., Raziuddin R., Miki T. (2004). Nucleotide exchange factor ECT2 interacts with the polarity protein complex Par6/Par3/protein kinase Czeta (PKCzeta) and regulates PKCzeta activity. Mol. Cell. Biol. 24: 6665—6675. PMID 15254234 DOI:10.1128/MCB.24.15.6665-6675.2004

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15943 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9NPB6 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»