PARP16

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4F0D

Ідентифікатори

Символи

PARP16, ARTD15, C15orf30, pART15, poly(ADP-ribose) polymerase family member 16

Зовнішні ІД

MGI: 2446133 HomoloGene: 9878 GeneCards: PARP16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • kinase binding • protein serine/threonine kinase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • glycosyltransferase activity • NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • protein ADP-ribosylase activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • nuclear envelope • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • endoplasmic reticulum tubular network • гіалоплазма
Біологічний процес	• Відповідь на незгорнуті білки • protein auto-ADP-ribosylation • response to unfolded protein • protein ADP-ribosylation • negative regulation of cell death • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity • NAD biosynthesis via nicotinamide riboside salvage pathway • cellular response to leukemia inhibitory factor • IRE1-mediated unfolded protein response • protein mono-ADP-ribosylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54956


214424

Ensembl


ENSG00000138617


ENSMUSG00000032392

UniProt


Q8N5Y8


Q7TMM8

RefSeq (мРНК)


NM_017851 NM_001316943 NM_001316944


NM_177460

RefSeq (білок)


NP_001303872 NP_001303873 NP_060321


NP_803411

Локус (UCSC)

Хр. 15: 65.23 – 65.3 Mb

Хр. 9: 65.1 – 65.15 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PARP16 (англ. Poly(ADP-ribose) polymerase family member 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 36 383^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQPSGWAAAR	EAAGRDMLAA	DLRCSLFASA	LQSYKRDSVL	RPFPASYARG
DCKDFEALLA	DASKLPNLKE	LLQSSGDNHK	RAWDLVSWIL	SSKVLTIHSA
GKAEFEKIQK	LTGAPHTPVP	APDFLFEIEY	FDPANAKFYE	TKGERDLIYA
FHGSRLENFH	SIIHNGLHCH	LNKTSLFGEG	TYLTSDLSLA	LIYSPHGHGW
QHSLLGPILS	CVAVCEVIDH	PDVKCQTKKK	DSKEIDRRRA	RIKHSEGGDI
PPKYFVVTNN	QLLRVKYLLV	YSQKPPKRAS	SQLSWFSSHW	FTVMISLYLL
LLLIVSVINS	SAFQHFWNRA	KR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на порушення конформації білку, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hottiger M.O., Hassa P.O., Luscher B., Schuler H., Koch-Nolte F. (2010). Toward a unified nomenclature for mammalian ADP-ribosyltransferases. Trends Biochem. Sci. 35: 208—219. PMID 20106667 DOI:10.1016/j.tibs.2009.12.003
Jwa M., Chang P. (2012). PARP16 is a tail-anchored endoplasmic reticulum protein required for the PERK-and IRE1alpha-mediated unfolded protein response. Nat. Cell Biol. 14: 1223—1230. PMID 23103912 DOI:10.1038/ncb2593
Di Paola S., Micaroni M., Di Tullio G., Buccione R., Di Girolamo M. (2012). PARP16/ARTD15 is a novel endoplasmic-reticulum-associated mono-ADP-ribosyltransferase that interacts with, and modifies karyopherin-beta1. PLoS ONE. 7: E37352—E37352. PMID 22701565 DOI:10.1371/journal.pone.0037352
Karlberg T., Thorsell A.G., Kallas A., Schuler H. (2012). Crystal structure of human ADP-ribose transferase ARTD15/PARP16 reveals a novel putative regulatory domain. J. Biol. Chem. 287: 24077—24081. PMID 22661712 DOI:10.1074/jbc.M112.379289

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26040 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8N5Y8 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 11 вересня 2017.