PATZ1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EPP, 2EPQ, 2EPR, 2EPS, 2YT9

Ідентифікатори

Символи

PATZ1, MAZR, PATZ, RIAZ, ZBTB19, ZNF278, ZSG, dJ400N23, POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1

Зовнішні ІД

OMIM: 605165 MGI: 1891832 HomoloGene: 8636 GeneCards: PATZ1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• регуляція експресії генів • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • T cell differentiation • male gonad development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23598


56218

Ensembl


ENSG00000100105


ENSMUSG00000020453

UniProt


Q9HBE1


Q5NBY9

RefSeq (мРНК)


NM_032052 NM_014323 NM_032050 NM_032051


NM_001253690 NM_001253691 NM_019574

RefSeq (білок)


NP_055138 NP_114439 NP_114440 NP_114441


NP_001240619 NP_001240620 NP_062520

Локус (UCSC)

Хр. 22: 31.33 – 31.35 Mb

Хр. 11: 3.24 – 3.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PATZ1 (англ. POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 687 амінокислот, а молекулярна маса — 74 060^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERVNDASCG	PSGCYTYQVS	RHSTEMLHNL	NQQRKNGGRF	CDVLLRVGDE
SFPAHRAVLA	ACSEYFESVF	SAQLGDGGAA	DGGPADVGGA	TAAPGGGAGG
SRELEMHTIS	SKVFGDILDF	AYTSRIVVRL	ESFPELMTAA	KFLLMRSVIE
ICQEVIKQSN	VQILVPPARA	DIMLFRPPGT	SDLGFPLDMT	NGAALAANSN
GIAGSMQPEE	EAARAAGAAI	AGQASLPVLP	GVDRLPMVAG	PLSPQLLTSP
FPSVASSAPP	LTGKRGRGRP	RKANLLDSMF	GSPGGLREAG	ILPCGLCGKV
FTDANRLRQH	EAQHGVTSLQ	LGYIDLPPPR	LGENGLPISE	DPDGPRKRSR
TRKQVACEIC	GKIFRDVYHL	NRHKLSHSGE	KPYSCPVCGL	RFKRKDRMSY
HVRSHDGSVG	KPYICQSCGK	GFSRPDHLNG	HIKQVHTSER	PHKCQTCNAS
FATRDRLRSH	LACHEDKVPC	QVCGKYLRAA	YMADHLKKHS	EGPSNFCSIC
NRGFSSASYL	KVHVKTHHGV	PLPQVSRHQE	PILNGGAAFH	CARTYGNKEG
QKCSHQDPIE	SSDSYGDLSD	ASDLKTPEKQ	SANGSFSCDM	AVPKNKMESD
GEKKYPCPEC	GSFFRSKSYL	NKHIQKVHVR	ALGGPLGDLG	PALGSPFSPQ
QNMSLLESFG	FQIVQSAFAS	SLVDPEVDQQ	PMGPEGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13071 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HBE1 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.