PDGFB |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1PDG, 3MJG, 4HQU, 4HQX, 4QCI | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PDGFB, IBGC5, PDGF-2, PDGF2, SIS, SSV, c-sis, platelet derived growth factor subunit B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 190040 MGI: 97528 HomoloGene: 74303 GeneCards: PDGFB |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • protein heterodimerization activity • chemoattractant activity • platelet-derived growth factor receptor binding • platelet-derived growth factor binding • superoxide-generating NADPH oxidase activator activity • growth factor activity • identical protein binding • collagen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity |
---|
Клітинна компонента | • platelet alpha granule lumen • цитоплазма • extracellular region • Golgi membrane • basolateral plasma membrane • cell surface • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • Golgi lumen • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • activation of protein kinase B activity • positive regulation of DNA biosynthetic process • positive regulation of chemotaxis • cellular response to growth factor stimulus • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of cell division • heart development • positive regulation of glomerular filtration • positive regulation of mitotic nuclear division • positive regulation of MAP kinase activity • positive regulation of metanephric mesenchymal cell migration • positive regulation of hyaluronan biosynthetic process • MAPK cascade • protein phosphorylation • positive regulation of glomerular mesangial cell proliferation • cellular response to mycophenolic acid • positive regulation of fibroblast proliferation • activation of protein kinase activity • multicellular organism development • positive regulation of protein autophosphorylation • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • reactive oxygen species metabolic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein kinase C signaling • metanephric glomerular mesangial cell development • negative regulation of phosphatidylinositol biosynthetic process • response to wounding • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • cell chemotaxis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • platelet degranulation • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of DNA replication • GO:1901313 positive regulation of gene expression • embryonic placenta development • paracrine signaling • monocyte chemotaxis • positive regulation of endothelial cell proliferation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • positive regulation of calcium ion import • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • positive regulation of metanephric mesenchymal cell migration by platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • кровотворення • positive regulation of cell migration • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • extracellular matrix organization • negative regulation of protein binding • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of platelet activation • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration • positive chemotaxis • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation • interleukin-18-mediated signaling pathway • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression • positive regulation of smooth muscle cell migration • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell dedifferentiation • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway • regulation of signaling receptor activity • positive regulation of protein kinase B signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 39.22 – 39.24 Mb | Хр. 15: 80 – 80.01 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PDGFB (англ. Platelet derived growth factor subunit B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 241 амінокислот, а молекулярна маса — 27 283[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNRCWALFLS | | LCCYLRLVSA | | EGDPIPEELY | | EMLSDHSIRS | | FDDLQRLLHG |
DPGEEDGAEL | | DLNMTRSHSG | | GELESLARGR | | RSLGSLTIAE | | PAMIAECKTR |
TEVFEISRRL | | IDRTNANFLV | | WPPCVEVQRC | | SGCCNNRNVQ | | CRPTQVQLRP |
VQVRKIEIVR | | KKPIFKKATV | | TLEDHLACKC | | ETVAAARPVT | | RSPGGSQEQR |
AKTPQTRVTI | | RTVRVRRPPK | | GKHRKFKHTH | | DKTALKETLG | | A |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів, білків розвитку. Секретований назовні.
Література
- Collins T., Ginsburg D., Boss J.M., Orkin S.H., Pober J.S. (1985). Cultured human endothelial cells express platelet-derived growth factor B chain: cDNA cloning and structural analysis. Nature. 316: 748—750. PMID 4033772 DOI:10.1038/316748a0
- Ratner L., Josephs S.F., Jarrett R., Reitz M.S., Wong-Staal F. (1985). Nucleotide sequence of transforming human c-sis cDNA clones with homology to platelet-derived growth factor. Nucleic Acids Res. 13: 5007—5018. PMID 2991848 DOI:10.1093/nar/13.14.5007
- Rao C.D., Igarashi H., Chiu I.-M., Robbins K.C., Aaronson S.A. (1986). Structure and sequence of the human c-sis/platelet-derived growth factor 2 (SIS/PDGF2) transcriptional unit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 2392—2396. PMID 3517869 DOI:10.1073/pnas.83.8.2392
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Dirks R.P.H., Onnekink C., Jansen H.J., de Jong A., Bloemers H.P.J. (1995). A novel human c-sis mRNA species is transcribed from a promoter in c-sis intron 1 and contains the code for an alternative PDGF B-like protein. Nucleic Acids Res. 23: 2815—2822. PMID 7659502 DOI:10.1093/nar/23.15.2815
- Weich H.A., Sebald W., Schairer H.U., Hoppe J. (1986). The human osteosarcoma cell line U-2 OS expresses a 3.8 kilobase mRNA which codes for the sequence of the PDGF-B chain. FEBS Lett. 198: 344—348. PMID 3456904 DOI:10.1016/0014-5793(86)80433-1
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8800 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P01127 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |