PHC1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PHC1, EDR1, HPH1, MCPH11, RAE28, polyhomeotic homolog 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602978 MGI: 103248 HomoloGene: 107079 GeneCards: PHC1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
microcephaly 11, primary, autosomal recessive[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • PcG protein complex • PRC1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • multicellular organism development • histone ubiquitination • negative regulation of G0 to G1 transition |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001042623 NM_001271579 NM_007905 NM_001355215 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001036088 NP_001258508 NP_031931 NP_001342144 NP_001395176
| NP_001395177 NP_001395178 NP_001395179 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 8.91 – 8.94 Mb | Хр. 6: 122.29 – 122.32 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PHC1 (англ. Polyhomeotic homolog 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 004 амінокислот, а молекулярна маса — 105 534[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
METESEQNSN | | STNGSSSSGG | | SSRPQIAQMS | | LYERQAVQAL | | QALQRQPNAA |
QYFHQFMLQQ | | QLSNAQLHSL | | AAVQQATIAA | | SRQASSPNTS | | TTQQQTTTTQ |
ASINLATTSA | | AQLISRSQSV | | SSPSATTLTQ | | SVLLGNTTSP | | PLNQSQAQMY |
LRPQLGNLLQ | | VNRTLGRNVP | | LASQLILMPN | | GAVAAVQQEV | | PSAQSPGVHA |
DADQVQNLAV | | RNQQASAQGP | | QMQGSTQKAI | | PPGASPVSSL | | SQASSQALAV |
AQASSGATNQ | | SLNLSQAGGG | | SGNSIPGSMG | | PGGGGQAHGG | | LGQLPSSGMG |
GGSCPRKGTG | | VVQPLPAAQT | | VTVSQGSQTE | | AESAAAKKAE | | ADGSGQQNVG |
MNLTRTATPA | | PSQTLISSAT | | YTQIQPHSLI | | QQQQQIHLQQ | | KQVVIQQQIA |
IHHQQQFQHR | | QSQLLHTATH | | LQLAQQQQQQ | | QQQQQQQQQP | | QATTLTAPQP |
PQVPPTQQVP | | PSQSQQQAQT | | LVVQPMLQSS | | PLSLPPDAAP | | KPPIPIQSKP |
PVAPIKPPQL | | GAAKMSAAQQ | | PPPHIPVQVV | | GTRQPGTAQA | | QALGLAQLAA |
AVPTSRGMPG | | TVQSGQAHLA | | SSPPSSQAPG | | ALQECPPTLA | | PGMTLAPVQG |
TAHVVKGGAT | | TSSPVVAQVP | | AAFYMQSVHL | | PGKPQTLAVK | | RKADSEEERD |
DVSTLGSMLP | | AKASPVAESP | | KVMDEKSSLG | | EKAESVANVN | | ANTPSSELVA |
LTPAPSVPPP | | TLAMVSRQMG | | DSKPPQAIVK | | PQILTHIIEG | | FVIQEGAEPF |
PVGCSQLLKE | | SEKPLQTGLP | | TGLTENQSGG | | PLGVDSPSAE | | LDKKANLLKC |
EYCGKYAPAE | | QFRGSKRFCS | | MTCAKRYNVS | | CSHQFRLKRK | | KMKEFQEANY |
ARVRRRGPRR | | SSSDIARAKI | | QGKCHRGQED | | SSRGSDNSSY | | DEALSPTSPG |
PLSVRAGHGE | | RDLGNPNTAP | | PTPELHGINP | | VFLSSNPSRW | | SVEEVYEFIA |
SLQGCQEIAE | | EFRSQEIDGQ | | ALLLLKEEHL | | MSAMNIKLGP | | ALKICAKINV |
LKET |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PHC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3182 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, P78364 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |