PHF1
PHF1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PHF1, MTF2L2, PCL1, PHF2, TDRD19C, hPHD finger protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602881 MGI: 98647 HomoloGene: 7567 GeneCards: PHF1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 33.41 – 33.42 Mb | Хр. 17: 27.15 – 27.16 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PHF1 (англ. PHD finger protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 567 амінокислот, а молекулярна маса — 62 106[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAQPPRLSRS | GASSLWDPAS | PAPTSGPRPR | LWEGQDVLAR | WTDGLLYLGT | ||||
IKKVDSAREV | CLVQFEDDSQ | FLVLWKDISP | AALPGEELLC | CVCRSETVVP | ||||
GNRLVSCEKC | RHAYHQDCHV | PRAPAPGEGE | GTSWVCRQCV | FAIATKRGGA | ||||
LKKGPYARAM | LGMKLSLPYG | LKGLDWDAGH | LSNRQQSYCY | CGGPGEWNLK | ||||
MLQCRSCLQW | FHEACTQCLS | KPLLYGDRFY | EFECCVCRGG | PEKVRRLQLR | ||||
WVDVAHLVLY | HLSVCCKKKY | FDFDREILPF | TSENWDSLLL | GELSDTPKGE | ||||
RSSRLLSALN | SHKDRFISGR | EIKKRKCLFG | LHARMPPPVE | PPTGDGALTS | ||||
FPSGQGPGGG | VSRPLGKRRR | PEPEPLRRRQ | KGKVEELGPP | SAVRNQPEPQ | ||||
EQRERAHLQR | ALQASVSPPS | PSPNQSYQGS | SGYNFRPTDA | RCLPSSPIRM | ||||
FASFHPSAST | AGTSGDSGPP | DRSPLELHIG | FPTDIPKSAP | HSMTASSSSV | ||||
SSPSPGLPRR | SAPPSPLCRS | LSPGTGGGVR | GGVGYLSRGD | PVRVLARRVR | ||||
PDGSVQYLVE | WGGGGIF |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.
Література
- Coulson M., Robert S., Eyre H.J., Saint R. (1998). The identification and localization of a human gene with sequence similarity to Polycomblike of Drosophila melanogaster. Genomics. 48: 381—383. PMID 9545646 DOI:10.1006/geno.1997.5201
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Micci F., Panagopoulos I., Bjerkehagen B., Heim S. (2006). Consistent rearrangement of chromosomal band 6p21 with generation of fusion genes JAZF1/PHF1 and EPC1/PHF1 in endometrial stromal sarcoma. Cancer Res. 66: 107—112. PMID 16397222 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-05-2485
- Sarma K., Margueron R., Ivanov A., Pirrotta V., Reinberg D. (2008). Ezh2 requires PHF1 to efficiently catalyze H3 lysine 27 trimethylation in vivo. Mol. Cell. Biol. 28: 2718—2731. PMID 18285464 DOI:10.1128/MCB.02017-07
Примітки
Див. також
- Хромосома 6
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|