PLXDC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PLXDC1, TEM3, TEM7, plexin domain containing 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606826 MGI: 1919574 HomoloGene: 10700 GeneCards: PLXDC1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • neuronal cell body • receptor complex • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • внутрішньоклітинний • мембрана • bicellular tight junction • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • Ангіогенез • spinal cord development |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/04/PBB_GE_PLXDC1_214081_at_fs.png/250px-PBB_GE_PLXDC1_214081_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/35/PBB_GE_PLXDC1_219700_at_fs.png/250px-PBB_GE_PLXDC1_219700_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 39.06 – 39.15 Mb | Хр. 11: 97.81 – 97.88 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PLXDC1 (англ. Plexin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 55 760[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRGELWLLVL | | VLREAARALS | | PQPGAGHDEG | | PGSGWAAKGT | | VRGWNRRARE |
SPGHVSEPDR | | TQLSQDLGGG | | TLAMDTLPDN | | RTRVVEDNHS | | YYVSRLYGPS |
EPHSRELWVD | | VAEANRSQVK | | IHTILSNTHR | | QASRVVLSFD | | FPFYGHPLRQ |
ITIATGGFIF | | MGDVIHRMLT | | ATQYVAPLMA | | NFNPGYSDNS | | TVVYFDNGTV |
FVVQWDHVYL | | QGWEDKGSFT | | FQAALHHDGR | | IVFAYKEIPM | | SVPEISSSQH |
PVKTGLSDAF | | MILNPSPDVP | | ESRRRSIFEY | | HRIELDPSKV | | TSMSAVEFTP |
LPTCLQHRSC | | DACMSSDLTF | | NCSWCHVLQR | | CSSGFDRYRQ | | EWMDYGCAQE |
AEGRMCEDFQ | | DEDHDSASPD | | TSFSPYDGDL | | TTTSSSLFID | | SLTTEDDTKL |
NPYAGGDGLQ | | NNLSPKTKGT | | PVHLGTIVGI | | VLAVLLVAAI | | ILAGIYINGH |
PTSNAALFFI | | ERRPHHWPAM | | KFRSHPDHST | | YAEVEPSGHE | | KEGFMEAEQC |
|
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lee H.K., Seo I.A., Park H.K., Park H.T. (2006). Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 580: 2253—2257. PMID 16574105 DOI:10.1016/j.febslet.2006.03.033
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20945 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IUK5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |