PLXDC1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PLXDC1

Ідентифікатори

Символи

PLXDC1, TEM3, TEM7, plexin domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606826 MGI: 1919574 HomoloGene: 10700 GeneCards: PLXDC1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • neuronal cell body • receptor complex • клітинна мембрана • дендрит (нейробіологія) • внутрішньоклітинний • мембрана • bicellular tight junction • міжклітинний простір
Біологічний процес	• Ангіогенез • spinal cord development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57125


72324

Ensembl


ENSG00000161381


ENSMUSG00000017417

UniProt


Q8IUK5


Q91ZV7

RefSeq (мРНК)


NM_020405


NM_001163608 NM_028199

RefSeq (білок)


NP_065138


NP_001157080 NP_082475

Локус (UCSC)

Хр. 17: 39.06 – 39.15 Mb

Хр. 11: 97.81 – 97.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PLXDC1 (англ. Plexin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 55 760^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRGELWLLVL	VLREAARALS	PQPGAGHDEG	PGSGWAAKGT	VRGWNRRARE
SPGHVSEPDR	TQLSQDLGGG	TLAMDTLPDN	RTRVVEDNHS	YYVSRLYGPS
EPHSRELWVD	VAEANRSQVK	IHTILSNTHR	QASRVVLSFD	FPFYGHPLRQ
ITIATGGFIF	MGDVIHRMLT	ATQYVAPLMA	NFNPGYSDNS	TVVYFDNGTV
FVVQWDHVYL	QGWEDKGSFT	FQAALHHDGR	IVFAYKEIPM	SVPEISSSQH
PVKTGLSDAF	MILNPSPDVP	ESRRRSIFEY	HRIELDPSKV	TSMSAVEFTP
LPTCLQHRSC	DACMSSDLTF	NCSWCHVLQR	CSSGFDRYRQ	EWMDYGCAQE
AEGRMCEDFQ	DEDHDSASPD	TSFSPYDGDL	TTTSSSLFID	SLTTEDDTKL
NPYAGGDGLQ	NNLSPKTKGT	PVHLGTIVGI	VLAVLLVAAI	ILAGIYINGH
PTSNAALFFI	ERRPHHWPAM	KFRSHPDHST	YAEVEPSGHE	KEGFMEAEQC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee H.K., Seo I.A., Park H.K., Park H.T. (2006). Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 580: 2253—2257. PMID 16574105 DOI:10.1016/j.febslet.2006.03.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20945 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IUK5 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.