PNN |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PNN, DRS, DRSP, SDK3, memA, Pinin, pinin, desmosome associated protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603154 MGI: 1100514 HomoloGene: 37656 GeneCards: PNN |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • structural molecule activity • DNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • Проміжні філаменти • міжклітинні контакти • клітинне ядро • cell-cell junction • мембрана • Десмосома • exon-exon junction complex • клітинна мембрана • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • nuclear speck |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • адгезія клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/65/PBB_GE_PNN_212037_at_fs.png/250px-PBB_GE_PNN_212037_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/07/PBB_GE_PNN_212036_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PNN_212036_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 39.18 – 39.18 Mb | Хр. 12: 59.11 – 59.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PNN (англ. Pinin, desmosome associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 717 амінокислот, а молекулярна маса — 81 614[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVAVRTLQE | | QLEKAKESLK | | NVDENIRKLT | | GRDPNDVRPI | | QARLLALSGP |
GGGRGRGSLL | | LRRGFSDSGG | | GPPAKQRDLE | | GAVSRLGGER | | RTRRESRQES |
DPEDDDVKKP | | ALQSSVVATS | | KERTRRDLIQ | | DQNMDEKGKQ | | RNRRIFGLLM |
GTLQKFKQES | | TVATERQKRR | | QEIEQKLEVQ | | AEEERKQVEN | | ERRELFEERR |
AKQTELRLLE | | QKVELAQLQE | | EWNEHNAKII | | KYIRTKTKPH | | LFYIPGRMCP |
ATQKLIEESQ | | RKMNALFEGR | | RIEFAEQINK | | MEARPRRQSM | | KEKEHQVVRN |
EEQKAEQEEG | | KVAQREEELE | | ETGNQHNDVE | | IEEAGEEEEK | | EIAIVHSDAE |
KEQEEEEQKQ | | EMEVKMEEET | | EVRESEKQQD | | SQPEEVMDVL | | EMVENVKHVI |
ADQEVMETNR | | VESVEPSENE | | ASKELEPEME | | FEIEPDKECK | | SLSPGKENVS |
ALDMEKESEE | | KEEKESEPQP | | EPVAQPQPQS | | QPQLQLQSQS | | QPVLQSQPPS |
QPEDLSLAVL | | QPTPQVTQEQ | | GHLLPERKDF | | PVESVKLTEV | | PVEPVLTVHP |
ESKSKTKTRS | | RSRGRARNKT | | SKSRSRSSSS | | SSSSSSSTSS | | SSGSSSSSGS |
SSSRSSSSSS | | SSTSGSSSRD | | SSSSTSSSSE | | SRSRSRGRGH | | NRDRKHRRSV |
DRKRRDTSGL | | ERSHKSSKGG | | SSRDTKGSKD | | KNSRSDRKRS | | ISESSRSGKR |
SSRSERDRKS | | DRKDKRR |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, клітинних контактах.
Література
- Ouyang P., Sugrue S.P. (1996). Characterization of pinin, a novel protein associated with the desmosome-intermediate filament complex. J. Cell Biol. 135: 1027—1042. PMID 8922384 DOI:10.1083/jcb.135.4.1027
- Degen W.G.J., Agterbos M.A., Muyrers J.P.P., Bloemers H.P.J., Swart G.W.M. (1999). memA/DRS, a putative mediator of multiprotein complexes, is overexpressed in the metastasizing human melanoma cell lines BLM and MV3. Biochim. Biophys. Acta. 1444: 384—394. PMID 10095061 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00012-3
- Shi Y., Ouyang P., Sugrue S.P. (2000). Characterization of the gene encoding pinin/DRS/memA and evidence for its potential tumor suppressor function. Oncogene. 19: 289—297. PMID 10645008 DOI:10.1038/sj.onc.1203328
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brandner J., Reidenbach S., Franke W.W. (1997). Evidence that 'pinin', reportedly a differentiation-specific desmosomal protein, is actually a widespread nuclear protein. Differentiation. 62: 119—127. PMID 9447706 DOI:10.1046/j.1432-0436.1997.6230119.x
- Ouyang P. (1999). Antibodies differentiate desmosome-form and nucleus-form pinin: evidence that pinin is a moonlighting protein with dual location at the desmosome and within the nucleus. Biochem. Biophys. Res. Commun. 263: 192—200. PMID 10486276 DOI:10.1006/bbrc.1999.1353
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9162 (англ.) . Архів оригіналу за 3 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H307 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |