POF1B : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

POF1B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3BH9

Ідентифікатори

Символи

POF1B, POF, POF2B, premature ovarian failure, 1B, actin binding protein, POF1B actin binding protein

Зовнішні ІД

OMIM: 300603 MGI: 1916943 HomoloGene: 11785 GeneCards: POF1B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• actin binding • actin filament binding
Клітинна компонента	• Десмосома • міжклітинні контакти • мікрофіламент • Адгезивні контакти • bicellular tight junction
Біологічний процес	• epithelial cell morphogenesis • actin filament organization • actin cytoskeleton organization • bicellular tight junction assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79983


69693

Ensembl


ENSG00000124429


ENSMUSG00000034607

UniProt


Q8WVV4


Q8K4L4

RefSeq (мРНК)


NM_001307940 NM_024921


NM_181579

RefSeq (білок)


NP_001294869 NP_079197


NP_853557

Локус (UCSC)

Хр. X: 85.28 – 85.38 Mb

Хр. X: 111.55 – 111.61 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POF1B (англ. POF1B, actin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 68 065^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSSYWSETS	SSSCGTQQLP	EVLQCQPQHY	HCYHQSSQAQ	QPPEKNVVYE
RVRTYSGPMN	KVVQALDPFN	SREVLSPLKT	TSSYQNLVWS	DHSQELHSPT
LKISTCAPST	LHITQNTEQE	LHSPTVKLTT	YPQTTIRKYV	VQNPEQEPLS
QFLRGSHFFP	GNNVIYEKTI	RKVEKLNTDQ	GCHPQAQCHH	HIIQQPQVIH
SAHWQQPDSS	QQIQAITGNN	PISTHIGNEL	CHSGSSQICE	QVIIQDDGPE
KLDPRYFGEL	LADLSRKNTD	LYHCLLEHLQ	RIGGSKQDFE	STDESEDIES
LIPKGLSEFT	KQQIRYILQM	RGMSDKSLRL	VLSTFSNIRE	ELGHLQNDMT
SLENDKMRLE	KDLSFKDTQL	KEYEELLASV	RANNHQQQQG	LQDSSSKCQA
LEENNLSLRH	TLSDMEYRLK	ELEYCKRNLE	QENQNLRMQV	SETCTGPMLQ
AKMDEIGNHY	TEMVKNLRME	KDREICRLRS	QLNQYHKDVS	KREGSCSDFQ
FKLHELTSLL	EEKDSLIKRQ	SEELSKLRQE	IYSSHNQPST	GGRTTITTKK
YRTQYPILGL	LYDDYEYIPP	GSETQTIVIE	KTEDKYTCP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13711 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8WVV4 (англ.) . Архів оригіналу за 31 грудня 2016. Процитовано 13 вересня 2017.