POLR1C

Ідентифікатори

Символи

POLR1C, RPA39, RPA40, RPA5, RPAC1, TCS3, AC40, RPC40, HLD11, polymerase (RNA) I subunit C, RNA polymerase I subunit C, RNA polymerase I and III subunit C

Зовнішні ІД

OMIM: 610060 MGI: 103288 HomoloGene: 3586 GeneCards: POLR1C

Пов'язані генетичні захворювання

hypomyelinating leukodystrophy 11, Синдром Тричера Коллінза, 4H leukodystrophy^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein dimerization activity • RNA polymerase III activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase I activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • нуклеоплазма • RNA polymerase III complex • клітинне ядро • RNA polymerase I complex
Біологічний процес	• transcription by RNA polymerase I • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter • positive regulation of type I interferon production
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9533


20016

Ensembl


ENSG00000171453


ENSMUSG00000067148

UniProt


O15160


P52432

RefSeq (мРНК)


NM_004875 NM_203290 NM_001318876 NM_001363658


NM_009085

RefSeq (білок)


NP_001305805 NP_976035 NP_001350587


NP_033111

Локус (UCSC)

Хр. 6: 43.51 – 43.56 Mb

Хр. 17: 46.55 – 46.56 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLR1C (англ. RNA polymerase I subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 39 250^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAASQAVEEM	RSRVVLGEFG	VRNVHTTDFP	GNYSGYDDAW	DQDRFEKNFR
VDVVHMDENS	LEFDMVGIDA	AIANAFRRIL	LAEVPTMAVE	KVLVYNNTSI
VQDEILAHRL	GLIPIHADPR	LFEYRNQGDE	EGTEIDTLQF	RLQVRCTRNP
HAAKDSSDPN	ELYVNHKVYT	RHMTWIPLGN	QADLFPEGTI	RPVHDDILIA
QLRPGQEIDL	LMHCVKGIGK	DHAKFSPVAT	ASYRLLPDIT	LLEPVEGEAA
EELSRCFSPG	VIEVQEVQGK	KVARVANPRL	DTFSREIFRN	EKLKKVVRLA
RVRDHYIFSV	ESTGVLPPDV	LVSEAIKVLM	GKCRRFLDEL	DAVQMD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Dammann R., Pfeifer G.P. (1998). Cloning and characterization of the human RNA polymerase I subunit hRPA40. Biochim. Biophys. Acta. 1396: 153—157. PMID 9540830 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00206-6
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з POLR1C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20194 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, O15160 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.