POLR2E

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5IY6, 5IY9, 5IY8, 5IYA, 5IYB, 5IY7, 5IYC, 5IYD

Ідентифікатори

Символи

POLR2E, RPABC1, RPB5, XAP4, hRPB25, hsRPB5, polymerase (RNA) II subunit E, RNA polymerase II subunit E, RNA polymerase II, I and III subunit E

Зовнішні ІД

OMIM: 180664 MGI: 1913670 HomoloGene: 2018 GeneCards: POLR2E

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • RNA polymerase II activity • RNA polymerase III activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase I activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • RNA polymerase I complex • RNA polymerase III complex • РНК-полімераза II • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription • mRNA splicing, via spliceosome • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0022415 viral process • transcription by RNA polymerase III • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • snRNA transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • transcription, DNA-templated • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter • positive regulation of type I interferon production • somatic stem cell population maintenance • positive regulation of viral transcription
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5434


66420

Ensembl


ENSG00000099817


ENSMUSG00000004667

UniProt


P19388


Q80UW8

RefSeq (мРНК)


NM_002695 NM_001316323 NM_001316324


NM_025554

RefSeq (білок)


NP_001303252 NP_001303253 NP_002686


NP_079830

Локус (UCSC)

Хр. 19: 1.09 – 1.1 Mb

Хр. 10: 79.87 – 79.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLR2E (англ. RNA polymerase II subunit E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 210 амінокислот, а молекулярна маса — 24 551^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDEEETYRL	WKIRKTIMQL	CHDRGYLVTQ	DELDQTLEEF	KAQSGDKPSE
GRPRRTDLTV	LVAHNDDPTD	QMFVFFPEEP	KVGIKTIKVY	CQRMQEENIT
RALIVVQQGM	TPSAKQSLVD	MAPKYILEQF	LQQELLINIT	EHELVPEHVV
MTKEEVTELL	ARYKLRENQL	PRIQAGDPVA	RYFGIKRGQV	VKIIRPSETA
GRYITYRLVQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Pati U.K., Weissman S.M. (1989). Isolation and molecular characterization of a cDNA encoding the 23-kDa subunit of human RNA polymerase II. J. Biol. Chem. 264: 13114—13121. PMID 2753903
Pati U.K., Weissman S.M. (1991). J. Biol. Chem. 266: 13468—13468. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 2071613
Cheong J.H., Yi M., Lin Y., Murakami S. (1995). Human RPB5, a subunit shared by eukaryotic nuclear RNA polymerases, binds human hepatitis B virus X protein and may play a role in X transactivation. EMBO J. 14: 143—150. PMID 7828586

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9192 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P19388 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.