PRPF8
PRPF8 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PRPF8, pre-mRNA processing factor 8, HPRP8, PRP8, PRPC8, RP13, SNRNP220 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607300 MGI: 2179381 HomoloGene: 4706 GeneCards: PRPF8 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
retinitis pigmentosa 13[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 17: 1.65 – 1.68 Mb | Хр. 11: 75.38 – 75.4 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PRPF8 (англ. Pre-mRNA processing factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 335 амінокислот, а молекулярна маса — 273 600[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAGVFPYRGP | GNPVPGPLAP | LPDYMSEEKL | QEKARKWQQL | QAKRYAEKRK | ||||
FGFVDAQKED | MPPEHVRKII | RDHGDMTNRK | FRHDKRVYLG | ALKYMPHAVL | ||||
KLLENMPMPW | EQIRDVPVLY | HITGAISFVN | EIPWVIEPVY | ISQWGSMWIM | ||||
MRREKRDRRH | FKRMRFPPFD | DEEPPLDYAD | NILDVEPLEA | IQLELDPEED | ||||
APVLDWFYDH | QPLRDSRKYV | NGSTYQRWQF | TLPMMSTLYR | LANQLLTDLV | ||||
DDNYFYLFDL | KAFFTSKALN | MAIPGGPKFE | PLVRDINLQD | EDWNEFNDIN | ||||
KIIIRQPIRT | EYKIAFPYLY | NNLPHHVHLT | WYHTPNVVFI | KTEDPDLPAF | ||||
YFDPLINPIS | HRHSVKSQEP | LPDDDEEFEL | PEFVEPFLKD | TPLYTDNTAN | ||||
GIALLWAPRP | FNLRSGRTRR | ALDIPLVKNW | YREHCPAGQP | VKVRVSYQKL | ||||
LKYYVLNALK | HRPPKAQKKR | YLFRSFKATK | FFQSTKLDWV | EVGLQVCRQG | ||||
YNMLNLLIHR | KNLNYLHLDY | NFNLKPVKTL | TTKERKKSRF | GNAFHLCREV | ||||
LRLTKLVVDS | HVQYRLGNVD | AFQLADGLQY | IFAHVGQLTG | MYRYKYKLMR | ||||
QIRMCKDLKH | LIYYRFNTGP | VGKGPGCGFW | AAGWRVWLFF | MRGITPLLER | ||||
WLGNLLARQF | EGRHSKGVAK | TVTKQRVESH | FDLELRAAVM | HDILDMMPEG | ||||
IKQNKARTIL | QHLSEAWRCW | KANIPWKVPG | LPTPIENMIL | RYVKAKADWW | ||||
TNTAHYNRER | IRRGATVDKT | VCKKNLGRLT | RLYLKAEQER | QHNYLKDGPY | ||||
ITAEEAVAVY | TTTVHWLESR | RFSPIPFPPL | SYKHDTKLLI | LALERLKEAY | ||||
SVKSRLNQSQ | REELGLIEQA | YDNPHEALSR | IKRHLLTQRA | FKEVGIEFMD | ||||
LYSHLVPVYD | VEPLEKITDA | YLDQYLWYEA | DKRRLFPPWI | KPADTEPPPL | ||||
LVYKWCQGIN | NLQDVWETSE | GECNVMLESR | FEKMYEKIDL | TLLNRLLRLI | ||||
VDHNIADYMT | AKNNVVINYK | DMNHTNSYGI | IRGLQFASFI | VQYYGLVMDL | ||||
LVLGLHRASE | MAGPPQMPND | FLSFQDIATE | AAHPIRLFCR | YIDRIHIFFR | ||||
FTADEARDLI | QRYLTEHPDP | NNENIVGYNN | KKCWPRDARM | RLMKHDVNLG | ||||
RAVFWDIKNR | LPRSVTTVQW | ENSFVSVYSK | DNPNLLFNMC | GFECRILPKC | ||||
RTSYEEFTHK | DGVWNLQNEV | TKERTAQCFL | RVDDESMQRF | HNRVRQILMA | ||||
SGSTTFTKIV | NKWNTALIGL | MTYFREAVVN | TQELLDLLVK | CENKIQTRIK | ||||
IGLNSKMPSR | FPPVVFYTPK | ELGGLGMLSM | GHVLIPQSDL | RWSKQTDVGI | ||||
THFRSGMSHE | EDQLIPNLYR | YIQPWESEFI | DSQRVWAEYA | LKRQEAIAQN | ||||
RRLTLEDLED | SWDRGIPRIN | TLFQKDRHTL | AYDKGWRVRT | DFKQYQVLKQ | ||||
NPFWWTHQRH | DGKLWNLNNY | RTDMIQALGG | VEGILEHTLF | KGTYFPTWEG | ||||
LFWEKASGFE | ESMKWKKLTN | AQRSGLNQIP | NRRFTLWWSP | TINRANVYVG | ||||
FQVQLDLTGI | FMHGKIPTLK | ISLIQIFRAH | LWQKIHESIV | MDLCQVFDQE | ||||
LDALEIETVQ | KETIHPRKSY | KMNSSCADIL | LFASYKWNVS | RPSLLADSKD | ||||
VMDSTTTQKY | WIDIQLRWGD | YDSHDIERYA | RAKFLDYTTD | NMSIYPSPTG | ||||
VLIAIDLAYN | LHSAYGNWFP | GSKPLIQQAM | AKIMKANPAL | YVLRERIRKG | ||||
LQLYSSEPTE | PYLSSQNYGE | LFSNQIIWFV | DDTNVYRVTI | HKTFEGNLTT | ||||
KPINGAIFIF | NPRTGQLFLK | IIHTSVWAGQ | KRLGQLAKWK | TAEEVAALIR | ||||
SLPVEEQPKQ | IIVTRKGMLD | PLEVHLLDFP | NIVIKGSELQ | LPFQACLKVE | ||||
KFGDLILKAT | EPQMVLFNLY | DDWLKTISSY | TAFSRLILIL | RALHVNNDRA | ||||
KVILKPDKTT | ITEPHHIWPT | LTDEEWIKVE | VQLKDLILAD | YGKKNNVNVA | ||||
SLTQSEIRDI | ILGMEISAPS | QQRQQIAEIE | KQTKEQSQLT | ATQTRTVNKH | ||||
GDEIITSTTS | NYETQTFSSK | TEWRVRAISA | ANLHLRTNHI | YVSSDDIKET | ||||
GYTYILPKNV | LKKFICISDL | RAQIAGYLYG | VSPPDNPQVK | EIRCIVMVPQ | ||||
WGTHQTVHLP | GQLPQHEYLK | EMEPLGWIHT | QPNESPQLSP | QDVTTHAKIM | ||||
ADNPSWDGEK | TIIITCSFTP | GSCTLTAYKL | TPSGYEWGRQ | NTDKGNNPKG | ||||
YLPSHYERVQ | MLLSDRFLGF | FMVPAQSSWN | YNFMGVRHDP | NMKYELQLAN | ||||
PKEFYHEVHR | PSHFLNFALL | QEGEVYSADR | EDLYA |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Luo H.R., Moreau G.A., Levin N., Moore M.J. (1999). The human Prp8 protein is a component of both U2- and U12-dependent spliceosomes. RNA. 5: 893—908. PMID 10411133 DOI:10.1017/S1355838299990520
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Anderson G.J., Bach M., Luehrmann R., Beggs J.D. (1989). Conservation between yeast and man of a protein associated with U5 small nuclear ribonucleoprotein. Nature. 342: 819—821. PMID 2532307 DOI:10.1038/342819a0
- Bach M., Winkelmann G., Luehrmann R. (1989). 20S small nuclear ribonucleoprotein U5 shows a surprisingly complex protein composition. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 6038—6042. PMID 2527369 DOI:10.1073/pnas.86.16.6038
- Pinto A.L., Steitz J.A. (1989). The mammalian analogue of the yeast PRP8 splicing protein is present in the U4/5/6 small nuclear ribonucleoprotein particle and the spliceosome. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 8742—8746. PMID 2479028 DOI:10.1073/pnas.86.22.8742
- Garcia-Blanco M.A., Anderson G.J., Beggs J., Sharp P.A. (1990). A mammalian protein of 220 kDa binds pre-mRNAs in the spliceosome: a potential homologue of the yeast PRP8 protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 3082—3086. PMID 2139226 DOI:10.1073/pnas.87.8.3082
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRPF8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17340 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2016. Процитовано 28 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q6P2Q9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 квітня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.
Див. також
- Хромосома 17
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|