PYGO1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

PYGO1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2VP7, 2VPB, 2VPD, 2VPE, 2VPG

Ідентифікатори

Символи

PYGO1, pygopus family PHD finger 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606902 MGI: 1919385 HomoloGene: 41050 GeneCards: PYGO1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • methylated histone binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• protein localization to nucleus • spermatid nucleus differentiation • post-embryonic development • Wnt signaling pathway • hematopoietic progenitor cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • розвиток нирки • spermatid development • beta-catenin-TCF complex assembly • canonical Wnt signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26108


72135

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000034910

UniProt


Q9Y3Y4


Q9D0P5

RefSeq (мРНК)


NM_015617 NM_001330326 NM_001367806


NM_028116

RefSeq (білок)


NP_001317255 NP_056432 NP_001354735


NP_082392

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 9: 72.83 – 72.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PYGO1 (англ. Pygopus family PHD finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 45 116^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAENSPAPA	YKVSSHGGDS	GLDGLGGPGV	QLGSPDKKKR	KANTQGPSFP
PLSEYAPPPN	PNSDHLVAAN	PFDDNYNTIS	YKPLPSSNPY	LGPGYPGFGG
YSTFRMPPHV	PPRMSSPYCG	PYSLRNQPHP	FPQNPLGMGF	NRPHAFNFGP
HDNSSFGNPS	YNNALSQNVN	MPNQHFRQNP	AENFSQIPPQ	NASQVSNPDL
ASNFVPGNNS	NFTSPLESNH	SFIPPPNTFG	QAKAPPPKQD	FTQGATKNTN
QNSSAHPPHL	NMDDTVNQSN	IELKNVNRNN	AVNQENSRSS	STEATNNNPA
NGTQNKPRQP	RGAADACTTE	KSNKSSLHPN	RHGHSSSDPV	YPCGICTNEV
NDDQDAILCE	ASCQKWFHRI	CTGMTETAYG	LLTAEASAVW	GCDTCMADKD
VQLMRTRETF	GPSAVGSDA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Hoffmans R., Basler K. (2007). BCL9-2 binds Arm/beta-catenin in a Tyr142-independent manner and requires Pygopus for its function in Wg/Wnt signaling. Mech. Dev. 124: 59—67. PMID 17113272 DOI:10.1016/j.mod.2006.09.006

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30256 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y3Y4 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.