RAB8A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QBT, 3TNF, 4LHV, 4LHW, 4LHX, 4LHY, 4LHZ, 4LI0

Ідентифікатори

Символи

RAB8A, MEL, RAB8, member RAS oncogene family

Зовнішні ІД

OMIM: 165040 MGI: 96960 HomoloGene: 100934 GeneCards: RAB8A

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Viroporin 3a^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GDP binding • GTP binding • myosin V binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • GO:0006184 GTPase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • ciliary basal body • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • центросома • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Синаптичні бульбашки • Golgi membrane • війка • ciliary base • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • phagocytic vesicle • Центріоль • екзосома • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0005578 Позаклітинна матриця • клітинна мембрана • trans-Golgi network transport vesicle • trans-Golgi network membrane • dendritic spine • recycling endosome membrane • non-motile cilium • secretory granule membrane • midbody • синапс • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • regulation of protein transport • аксоноґенеза • vesicle docking involved in exocytosis • protein secretion • regulation of protein localization • cell projection organization • G2/M transition of mitotic cell cycle • Golgi vesicle fusion to target membrane • protein transport • protein localization to plasma membrane • cellular response to insulin stimulus • cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking • neurotransmitter receptor transport to postsynaptic membrane • regulation of autophagy • автофагія • посттрансляційна модифікація • regulation of exocytosis • GO:0015915 транспорт • intracellular protein transport • Rab protein signal transduction • neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4218


17274

Ensembl


ENSG00000167461


ENSMUSG00000003037

UniProt


P61006


P55258

RefSeq (мРНК)


NM_005370


NM_023126

RefSeq (білок)


NP_005361 NP_005361.2


NP_075615

Локус (UCSC)

Хр. 19: 16.11 – 16.13 Mb

Хр. 8: 72.92 – 72.94 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RAB8A (англ. RAB8A, member RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 207 амінокислот, а молекулярна маса — 23 668^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKTYDYLFK	LLLIGDSGVG	KTCVLFRFSE	DAFNSTFIST	IGIDFKIRTI
ELDGKRIKLQ	IWDTAGQERF	RTITTAYYRG	AMGIMLVYDI	TNEKSFDNIR
NWIRNIEEHA	SADVEKMILG	NKCDVNDKRQ	VSKERGEKLA	LDYGIKFMET
SAKANINVEN	AFFTLARDIK	AKMDKKLEGN	SPQGSNQGVK	ITPDQQKRSS
FFRCVLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, біогенез та деградація війок. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, війках, цитоплазматичних везикулах, апараті Гольджі, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Joberty G., Tavitian A., Zahraoui A. (1993). Isoprenylation of Rab proteins possessing a C-terminal CaaX motif. FEBS Lett. 330: 323—328. PMID 8375503 DOI:10.1016/0014-5793(93)80897-4
Hattula K., Furuhjelm J., Arffman A., Peranen J. (2002). A Rab8-specific GDP/GTP exchange factor is involved in actin remodeling and polarized membrane transport. Mol. Biol. Cell. 13: 3268—3280. PMID 12221131 DOI:10.1091/mbc.E02-03-0143
Pohl C., Jentsch S. (2008). Final stages of cytokinesis and midbody ring formation are controlled by BRUCE. Cell. 132: 832—845. PMID 18329369 DOI:10.1016/j.cell.2008.01.012
Sharma M., Giridharan S.S., Rahajeng J., Naslavsky N., Caplan S. (2009). MICAL-L1 links EHD1 to tubular recycling endosomes and regulates receptor recycling. Mol. Biol. Cell. 20: 5181—5194. PMID 19864458 DOI:10.1091/mbc.E09-06-0535
Seto S., Tsujimura K., Koide Y. (2011). Rab GTPases regulating phagosome maturation are differentially recruited to mycobacterial phagosomes. Traffic. 12: 407—420. PMID 21255211 DOI:10.1111/j.1600-0854.2011.01165.x

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB8A, member RAS oncogene family, isoform CRA_a переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з RAB8A, member RAS oncogene family переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7007 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
↑ UniProt, P61006 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.