RAD23A |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/44/Protein_RAD23A_PDB_1dv0.png/250px-Protein_RAD23A_PDB_1dv0.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1DV0, 1F4I, 1IFY, 1OQY, 1P98, 1P9D, 1QZE, 1TP4, 2WYQ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RAD23A, HHR23A, HR23A, RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600061 MGI: 105126 HomoloGene: 48322 GeneCards: RAD23A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • single-stranded DNA binding • ubiquitin-specific protease binding • damaged DNA binding • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase binding • ubiquitin binding • proteasome binding |
---|
Клітинна компонента | • Протеасома • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • nucleotide-excision repair • positive regulation of viral genome replication • GO:0022415 viral process • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination • protein destabilization • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of cell cycle |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d5/PBB_GE_RAD23A_212889_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAD23A_212889_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b2/PBB_GE_RAD23A_201039_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAD23A_201039_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/50/PBB_GE_RAD23A_201046_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RAD23A_201046_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001270362 NM_001270363 NM_005053 |
| NM_001297606 NM_001297607 NM_009010 NM_001378894 NM_001378895
| NM_001378896 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001257291 NP_001257292 NP_005044 |
| NP_001284535 NP_001284536 NP_033036 NP_001365823 NP_001365824
| NP_001365825 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 12.95 – 12.95 Mb | Хр. 8: 85.56 – 85.57 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RAD23A (англ. RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 363 амінокислот, а молекулярна маса — 39 609[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAVTITLKTL | | QQQTFKIRME | | PDETVKVLKE | | KIEAEKGRDA | | FPVAGQKLIY |
AGKILSDDVP | | IRDYRIDEKN | | FVVVMVTKTK | | AGQGTSAPPE | | ASPTAAPESS |
TSFPPAPTSG | | MSHPPPAARE | | DKSPSEESAP | | TTSPESVSGS | | VPSSGSSGRE |
EDAASTLVTG | | SEYETMLTEI | | MSMGYERERV | | VAALRASYNN | | PHRAVEYLLT |
GIPGSPEPEH | | GSVQESQVSE | | QPATEAAGEN | | PLEFLRDQPQ | | FQNMRQVIQQ |
NPALLPALLQ | | QLGQENPQLL | | QQISRHQEQF | | IQMLNEPPGE | | LADISDVEGE |
VGAIGEEAPQ | | MNYIQVTPQE | | KEAIERLKAL | | GFPESLVIQA | | YFACEKNENL |
AANFLLSQNF | | DDE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wang G., Sawai N., Kotliarova S., Kanazawa I., Nukina N. (2000). Ataxin-3, the MJD1 gene product, interacts with the two human homologs of yeast DNA repair protein RAD23, HHR23A and HHR23B. Hum. Mol. Genet. 9: 1795—1803. PMID 10915768 DOI:10.1093/hmg/9.12.1795
- Wang Q., Goh A.M., Howley P.M., Walters K.J. (2003). Ubiquitin recognition by the DNA repair protein hHR23a. Biochemistry. 42: 13529—13535. PMID 14621999 DOI:10.1021/bi035391j
- Raasi S., Pickart C.M. (2003). Rad23 ubiquitin-associated domains (UBA) inhibit 26 S proteasome-catalyzed proteolysis by sequestering lysine 48-linked polyubiquitin chains. J. Biol. Chem. 278: 8951—8959. PMID 12643283 DOI:10.1074/jbc.M212841200
- Raasi S., Orlov I., Fleming K.G., Pickart C.M. (2004). Binding of polyubiquitin chains to ubiquitin-associated (UBA) domains of HHR23A. J. Mol. Biol. 341: 1367—1379. PMID 15321727 DOI:10.1016/j.jmb.2004.06.057
- Chen L., Madura K. (2006). Evidence for distinct functions for human DNA repair factors hHR23A and hHR23B. FEBS Lett. 580: 3401—3408. PMID 16712842 DOI:10.1016/j.febslet.2006.05.012
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9812 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P54725 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |