RALGPS1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3QXL

Ідентифікатори

Символи

RALGPS1, RALGEF2, RALGPS1A, Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1

Зовнішні ІД

OMIM: 614444 MGI: 1922008 HomoloGene: 65163 GeneCards: RALGPS1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • компонент клітини
Біологічний процес	• small GTPase mediated signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of Ral protein signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9649


241308

Ensembl


ENSG00000136828


ENSMUSG00000038831

UniProt


Q5JS13


A2AR50

RefSeq (мРНК)

NM_001190728 NM_001190729 NM_001190730 NM_014636 NM_001322320
NM_001322321 NM_001322322 NM_001322323 NM_001322324 NM_001322325 NM_001366399 NM_001366400 NM_001366401


NM_001290570 NM_001290572 NM_175211

RefSeq (білок)

NP_001177657 NP_001177658 NP_001177659 NP_001309249 NP_001309250
NP_001309251 NP_001309252 NP_001309253 NP_001309254 NP_055451 NP_001353328 NP_001353329 NP_001353330


NP_001277499 NP_001277501 NP_780420

Локус (UCSC)

Хр. 9: 126.91 – 127.22 Mb

Хр. 2: 33.13 – 33.37 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RALGPS1 (англ. Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 62 133^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYKRNGLMAS	VLVTSATPQG	SSSSDSLEGQ	SCDYASKSYD	AVVFDVLKVT
PEEFASQITL	MDIPVFKAIQ	PEELASCGWS	KKEKHSLAPN	VVAFTRRFNQ
VSFWVVREIL	TAQTLKIRAE	ILSHFVKIAK	KLLELNNLHS	LMSVVSALQS
APIFRLTKTW	ALLNRKDKTT	FEKLDYLMSK	EDNYKRTREY	IRSLKMVPSI
PYLGIYLLDL	IYIDSAYPAS	GSIMENEQRS	NQMNNILRII	ADLQVSCSYD
HLTTLPHVQK	YLKSVRYIEE	LQKFVEDDNY	KLSLRIEPGS	SSPRLVSSKE
DLAGPSAGSG	SARFSRRPTC	PDTSVAGSLP	TPPVPRHRKS	HSLGNNMMCQ
LSVVESKSAT	FPSEKARHLL	DDSVLESRSP	RRGLALTSSS	AVTNGLSLGS
SESSEFSEEM	SSGLESPTGP	CICSLGNSAA	VPTMEGPLRR	KTLLKEGRKP
ALSSWTRYWV	ILSGSTLLYY	GAKSLRGTDR	KHYKSTPGKK	VSIVGWMVQL
PDDPEHPDIF	QLNNPDKGNV	YKFQTGSRFH	AILWHKHLDD	ACKSNRPQVP
ANLMSFE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Rebhun J.F., Chen H., Quilliam L.A. (2000). Identification and characterization of a new family of guanine nucleotide exchange factors for the ras-related GTPase Ral. J. Biol. Chem. 275: 13406—13410. PMID 10747847 DOI:10.1074/jbc.C000085200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16851 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q5JS13 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.