RBBP4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2XU7, 3GFC, 4PBY, 4PBZ, 4PC0, 4R7A, 5FXY

Ідентифікатори

Символи

RBBP4, NURF55, RBAP48, lin-53, retinoblastoma binding protein 4, RB binding protein 4, chromatin remodeling factor

Зовнішні ІД

OMIM: 602923 MGI: 1194912 HomoloGene: 21153 GeneCards: RBBP4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • GO:0031493 histone binding • histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding • histone deacetylase activity
Клітинна компонента	• NuRD complex • ESC/E(Z) complex • CAF-1 complex • Sin3 complex • нуклеоплазма • NURF complex • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • реплікація ДНК • negative regulation of gene expression, epigenetic • клітинний цикл • negative regulation of cell population proliferation • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone deacetylation • response to growth hormone • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5928


19646

Ensembl


ENSG00000162521


ENSMUSG00000057236

UniProt


Q09028


Q60972

RefSeq (мРНК)


NM_005610 NM_001135255 NM_001135256


NM_009030

RefSeq (білок)


NP_001128727 NP_001128728 NP_005601


NP_033056

Локус (UCSC)

Хр. 1: 32.65 – 32.69 Mb

Хр. 4: 129.2 – 129.23 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBBP4 (англ. RB binding protein 4, chromatin remodeling factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 656^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADKEAAFDD	AVEERVINEE	YKIWKKNTPF	LYDLVMTHAL	EWPSLTAQWL
PDVTRPEGKD	FSIHRLVLGT	HTSDEQNHLV	IASVQLPNDD	AQFDASHYDS
EKGEFGGFGS	VSGKIEIEIK	INHEGEVNRA	RYMPQNPCII	ATKTPSSDVL
VFDYTKHPSK	PDPSGECNPD	LRLRGHQKEG	YGLSWNPNLS	GHLLSASDDH
TICLWDISAV	PKEGKVVDAK	TIFTGHTAVV	EDVSWHLLHE	SLFGSVADDQ
KLMIWDTRSN	NTSKPSHSVD	AHTAEVNCLS	FNPYSEFILA	TGSADKTVAL
WDLRNLKLKL	HSFESHKDEI	FQVQWSPHNE	TILASSGTDR	RLNVWDLSKI
GEEQSPEDAE	DGPPELLFIH	GGHTAKISDF	SWNPNEPWVI	CSVSEDNIMQ
VWQMAENIYN	DEDPEGSVDP	EGQGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, реплікація ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Verreault A., Kaufman P.D., Kobayashi R., Stillman B. (1996). Nucleosome assembly by a complex of CAF-1 and acetylated histones H3/H4. Cell. 87: 95—104. PMID 8858152 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81326-4
Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (1997). Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. Cell. 89: 357—364. PMID 9150135 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80216-0
Qian Y.-W., Lee E.Y.-H.P. (1995). Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast. J. Biol. Chem. 270: 25507—25513. PMID 7503932 DOI:10.1074/jbc.270.43.25507
Taunton J., Hassig C.A., Schreiber S.L. (1996). A mammalian histone deacetylase related to the yeast transcriptional regulator Rpd3p. Science. 272: 408—411. PMID 8602529 DOI:10.1126/science.272.5260.408
Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.-P., Lane W.S., Reinberg D. (1998). The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. Cell. 95: 279—289. PMID 9790534 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9887 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q09028 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.