RBBP6 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2C7H, 2YSA, 2YUR, 3ZTG | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBBP6, MY038, P2P-R, PACT, RBQ-1, SNAMA, retinoblastoma binding protein 6, RB binding protein 6, ubiquitin ligase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600938 MGI: 894835 HomoloGene: 136812 GeneCards: RBBP6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • RNA binding • protein kinase binding |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • центр організації мікротрубочок • клітинне ядро • хромосома • цитоплазма • цитоскелет • гіалоплазма • центросома • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • in utero embryonic development • embryonic organ development • regulation of DNA replication • реплікація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • Убіквітин-залежний протеоліз • multicellular organism growth • somite development • mRNA processing • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_006910 NM_018703 NM_032626 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_008841 NP_061173 NP_116015 |
| | NP_035377 NP_778188 NP_001390011 NP_001390012 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 24.54 – 24.57 Mb | Хр. 7: 122.56 – 122.6 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBBP6 (англ. RB binding protein 6, ubiquitin ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 792 амінокислот, а молекулярна маса — 201 564[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSCVHYKFSS | | KLNYDTVTFD | | GLHISLCDLK | | KQIMGREKLK | | AADCDLQITN |
AQTKEEYTDD | | NALIPKNSSV | | IVRRIPIGGV | | KSTSKTYVIS | | RTEPAMATTK |
AIDDSSASIS | | LAQLTKTANL | | AEANASEEDK | | IKAMMSQSGH | | EYDPINYMKK |
PLGPPPPSYT | | CFRCGKPGHY | | IKNCPTNGDK | | NFESGPRIKK | | STGIPRSFMM |
EVKDPNMKGA | | MLTNTGKYAI | | PTIDAEAYAI | | GKKEKPPFLP | | EEPSSSSEED |
DPIPDELLCL | | ICKDIMTDAV | | VIPCCGNSYC | | DECIRTALLE | | SDEHTCPTCH |
QNDVSPDALI | | ANKFLRQAVN | | NFKNETGYTK | | RLRKQLPPPP | | PPIPPPRPLI |
QRNLQPLMRS | | PISRQQDPLM | | IPVTSSSTHP | | APSISSLTSN | | QSSLAPPVSG |
NPSSAPAPVP | | DITATVSISV | | HSEKSDGPFR | | DSDNKILPAA | | ALASEHSKGT |
SSIAITALME | | EKGYQVPVLG | | TPSLLGQSLL | | HGQLIPTTGP | | VRINTARPGG |
GRPGWEHSNK | | LGYLVSPPQQ | | IRRGERSCYR | | SINRGRHHSE | | RSQRTQGPSL |
PATPVFVPVP | | PPPLYPPPPH | | TLPLPPGVPP | | PQFSPQFPPG | | QPPPAGYSVP |
PPGFPPAPAN | | LSTPWVSSGV | | QTAHSNTIPT | | TQAPPLSREE | | FYREQRRLKE |
EEKKKSKLDE | | FTNDFAKELM | | EYKKIQKERR | | RSFSRSKSPY | | SGSSYSRSSY |
TYSKSRSGST | | RSRSYSRSFS | | RSHSRSYSRS | | PPYPRRGRGK | | SRNYRSRSRS |
HGYHRSRSRS | | PPYRRYHSRS | | RSPQAFRGQS | | PNKRNVPQGE | | TEREYFNRYR |
EVPPPYDMKA | | YYGRSVDFRD | | PFEKERYREW | | ERKYREWYEK | | YYKGYAAGAQ |
PRPSANRENF | | SPERFLPLNI | | RNSPFTRGRR | | EDYVGGQSHR | | SRNIGSNYPE |
KLSARDGHNQ | | KDNTKSKEKE | | SENAPGDGKG | | NKHKKHRKRR | | KGEESEGFLN |
PELLETSRKS | | REPTGVEENK | | TDSLFVLPSR | | DDATPVRDEP | | MDAESITFKS |
VSEKDKRERD | | KPKAKGDKTK | | RKNDGSAVSK | | KENIVKPAKG | | PQEKVDGERE |
RSPRSEPPIK | | KAKEETPKTD | | NTKSSSSSQK | | DEKITGTPRK | | AHSKSAKEHQ |
ETKPVKEEKV | | KKDYSKDVKS | | EKLTTKEEKA | | KKPNEKNKPL | | DNKGEKRKRK |
TEEKGVDKDF | | ESSSMKISKL | | EVTEIVKPSP | | KRKMEPDTEK | | MDRTPEKDKI |
SLSAPAKKIK | | LNRETGKKIG | | STENISNTKE | | PSEKLESTSS | | KVKQEKVKGK |
VRRKVTGTEG | | SSSTLVDYTS | | TSSTGGSPVR | | KSEEKTDTKR | | TVIKTMEEYN |
NDNTAPAEDV | | IIMIQVPQSK | | WDKDDFESEE | | EDVKSTQPIS | | SVGKPASVIK |
NVSTKPSNIV | | KYPEKESEPS | | EKIQKFTKDV | | SHEIIQHEVK | | SSKNSASSEK |
GKTKDRDYSV | | LEKENPEKRK | | NSTQPEKESN | | LDRLNEQGNF | | KSLSQSSKEA |
RTSDKHDSTR | | ASSNKDFTPN | | RDKKTDYDTR | | EYSSSKRRDE | | KNELTRRKDS |
PSRNKDSASG | | QKNKPREERD | | LPKKGTGDSK | | KSNSSPSRDR | | KPHDHKATYD |
TKRPNEETKS | | VDKNPCKDRE | | KHVLEARNNK | | ESSGNKLLYI | | LNPPETQVEK |
EQITGQIDKS | | TVKPKPQLSH | | SSRLSSDLTR | | ETDEAAFEPD | | YNESDSESNV |
SVKEEESSGN | | ISKDLKDKIV | | EKAKESLDTA | | AVVQVGISRN | | QSHSSPSVSP |
SRSHSPSGSQ | | TRSHSSSASS | | AESQDSKKKK | | KKKEKKKHKK | | HKKHKKHKKH |
AGTEVELEKS | | QKHKHKKKKS | | KKNKDKEKEK | | EKDDQKVKSV | | TV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, убіквітинування білків, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gao S., Witte M.M., Scott R.E. (2002). P2P-R protein localizes to the nucleolus of interphase cells and the periphery of chromosomes in mitotic cells which show maximum P2P-R immunoreactivity. J. Cell. Physiol. 191: 145—154. PMID 12064457 DOI:10.1002/jcp.10084
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Gao S., Witte M.M., Scott R.E. (2002). J. Cell. Physiol. 192: 359—360.
{{cite journal}}
: Пропущений або порожній |title=
(довідка)
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RBBP6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9889 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q7Z6E9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |