RBSN |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1YZM, 1Z0J, 1Z0K | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBSN, Rabenosyn-5, ZFYVE20, rabenosyn, RAB effector |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609511 MGI: 1925537 HomoloGene: 41477 GeneCards: RBSN |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding |
---|
Клітинна компонента | • ендосома • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • cytoplasmic side of endosome membrane • клітинна мембрана • endosome membrane • екзосома • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • endosomal vesicle fusion • ендоцитоз • vacuole inheritance • Golgi to endosome transport • зсідання крові • endosomal transport • protein transport • regulation of Golgi organization • Golgi to lysosome transport • early endosome to Golgi transport • GO:0015915 транспорт |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 15.07 – 15.1 Mb | Хр. 6: 92.16 – 92.19 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBSN (англ. Rabenosyn, RAB effector) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 88 870[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASLDDPGEV | | REGFLCPLCL | | KDLQSFYQLH | | SHYEEEHSGE | | DRDVKGQIKS |
LVQKAKKAKD | | RLLKREGDDR | | AESGTQGYES | | FSYGGVDPYM | | WEPQELGAVR |
SHLSDFKKHR | | AARIDHYVVE | | VNKLIIRLEK | | LTAFDRTNTE | | SAKIRAIEKS |
VVPWVNDQDV | | PFCPDCGNKF | | SIRNRRHHCR | | LCGSIMCKKC | | MELISLPLAN |
KLTSASKESL | | STHTSPSQSP | | NSVHGSRRGS | | ISSMSSVSSV | | LDEKDDDRIR |
CCTHCKDTLL | | KREQQIDEKE | | HTPDIVKLYE | | KLRLCMEKVD | | QKAPEYIRMA |
ASLNAGETTY | | SLEHASDLRV | | EVQKVYELID | | ALSKKILTLG | | LNQDPPPHPS |
NLRLQRMIRY | | SATLFVQEKL | | LGLMSLPTKE | | QFEELKKKRK | | EEMERKRAVE |
RQAALESQRR | | LEERQSGLAS | | RAANGEVASL | | RRGPAPLRKA | | EGWLPLSGGQ |
GQSEDSDPLL | | QQIHNITSFI | | RQAKAAGRMD | | EVRTLQENLR | | QLQDEYDQQQ |
TEKAIELSRR | | QAEEEDLQRE | | QLQMLREREL | | EREREQFRVA | | SLHTRTRSLD |
FREIGPFQLE | | PSREPRTHLA | | YALDLGSSPV | | PSSTAPKTPS | | LSSTQPTRVW |
SGPPAVGQER | | LPQSSMPQQH | | EGPSLNPFDE | | EDLSSPMEEA | | TTGPPAAGVS |
LDPSARILKE | | YNPFEEEDEE | | EEAVAGNPFI | | QPDSPAPNPF | | SEEDEHPQQR |
LSSPLVPGNP | | FEEPTCINPF | | EMDSDSGPEA | | EEPIEEELLL | | QQIDNIKAYI |
FDAKQCGRLD | | EVEVLTENLR | | ELKHTLAKQK | | GGTD |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- de Renzis S., Soennichsen B., Zerial M. (2002). Divalent Rab effectors regulate the sub-compartmental organization and sorting of early endosomes. Nat. Cell Biol. 4: 124—133. PMID 11788822 DOI:10.1038/ncb744
- Naslavsky N., Boehm M., Backlund P.S. Jr., Caplan S. (2004). Rabenosyn-5 and EHD1 interact and sequentially regulate protein recycling to the plasma membrane. Mol. Biol. Cell. 15: 2410—2422. PMID 15020713 DOI:10.1091/mbc.E03-10-0733
- Eathiraj S., Pan X., Ritacco C., Lambright D.G. (2005). Structural basis of family-wide Rab GTPase recognition by rabenosyn-5. Nature. 436: 415—419. PMID 16034420 DOI:10.1038/nature03798
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20759 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9H1K0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |