RCOR1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2IW5, 2UXN, 2UXX, 2V1D, 2X0L, 2XAF, 2XAG, 2XAH, 2XAJ, 2XAQ, 2XAS, 2Y48, 3ZMS, 3ZMT, 3ZMU, 3ZMV, 3ZMZ, 3ZN0, 3ZN1, 4BAY, 4KUM, 4UV8, 4UV9, 4UVA, 4UVB, 4UVC, 4UXN, 5L3D, 5L3B, 5L3C, 4XBF

Ідентифікатори

Символи

RCOR1, COREST, RCOR, REST corepressor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 607675 MGI: 106340 HomoloGene: 32246 GeneCards: RCOR1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor binding • histone deacetylase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента	• DNA repair complex • transcription repressor complex • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма
Біологічний процес	• histone H4 deacetylation • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • зсідання крові • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23186


217864

Ensembl


ENSG00000089902


ENSMUSG00000037896

UniProt


Q9UKL0


Q8CFE3

RefSeq (мРНК)


NM_015156


NM_198023

RefSeq (білок)


NP_055971


NP_932140

Локус (UCSC)

Хр. 14: 102.59 – 102.73 Mb

Хр. 12: 111.01 – 111.08 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RCOR1 (англ. REST corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 53 327^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPAMVEKGPE	VSGKRRGRNN	AAASASAAAA	SAAASAACAS	PAATAASGAA
ASSASAAAAS	AAAAPNNGQN	KSLAAAAPNG	NSSSNSWEEG	SSGSSSDEEH
GGGGMRVGPQ	YQAVVPDFDP	AKLARRSQER	DNLGMLVWSP	NQNLSEAKLD
EYIAIAKEKH	GYNMEQALGM	LFWHKHNIEK	SLADLPNFTP	FPDEWTVEDK
VLFEQAFSFH	GKTFHRIQQM	LPDKSIASLV	KFYYSWKKTR	TKTSVMDRHA
RKQKREREES	EDELEEANGN	NPIDIEVDQN	KESKKEVPPT	ETVPQVKKEK
HSTQAKNRAK	RKPPKGMFLS	QEDVEAVSAN	ATAATTVLRQ	LDMELVSVKR
QIQNIKQTNS	ALKEKLDGGI	EPYRLPEVIQ	KCNARWTTEE	QLLAVQAIRK
YGRDFQAISD	VIGNKSVVQV	KNFFVNYRRR	FNIDEVLQEW	EAEHGKEETN
GPSNQKPVKS	PDNSIKMPEE	EDEAPVLDVR	YASAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. (2001). CoREST is an integral component of the CoREST-human histone deacetylase complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1454—1458. PMID 11171972 DOI:10.1073/pnas.98.4.1454
Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200
Lee M.G., Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation. Nature. 437: 432—435. PMID 16079794 DOI:10.1038/nature04021
Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. (2005). Components of the REST/CoREST/histone deacetylase repressor complex are disrupted, modified, and translocated in HSV-1-infected cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 7571—7576. PMID 15897453 DOI:10.1073/pnas.0502658102

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17441 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UKL0 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.