RGMA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4UHY

Ідентифікатори

Символи

RGMA, RGM, repulsive guidance molecule family member a, repulsive guidance molecule BMP co-receptor a

Зовнішні ІД

OMIM: 607362 MGI: 2679262 HomoloGene: 10626 GeneCards: RGMA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferrin receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • coreceptor activity
Клітинна компонента	• anchored component of membrane • клітинна мембрана • ендоплазматичний ретикулум • мембрана
Біологічний процес	• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • negative regulation of axon regeneration • regulation of neuron projection development
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56963


244058

Ensembl


ENSG00000182175


ENSMUSG00000070509

UniProt


Q96B86


Q6PCX7

RefSeq (мРНК)

NM_020211 NM_001166283 NM_001166286 NM_001166287 NM_001166288
NM_001166289


NM_177740

RefSeq (білок)

NP_001159755 NP_001159758 NP_001159759 NP_001159760 NP_001159761
NP_064596


NP_808408

Локус (UCSC)

Хр. 15: 93.04 – 93.09 Mb

Хр. 7: 73.03 – 73.07 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RGMA (англ. Repulsive guidance molecule family member a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 49 347^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQPPRERLVV	TGRAGWMGMG	RGAGRSALGF	WPTLAFLLCS	FPAATSPCKI
LKCNSEFWSA	TSGSHAPASD	DTPEFCAALR	SYALCTRRTA	RTCRGDLAYH
SAVHGIEDLM	SQHNCSKDGP	TSQPRLRTLP	PAGDSQERSD	SPEICHYEKS
FHKHSATPNY	THCGLFGDPH	LRTFTDRFQT	CKVQGAWPLI	DNNYLNVQVT
NTPVLPGSAA	TATSKLTIIF	KNFQECVDQK	VYQAEMDELP	AAFVDGSKNG
GDKHGANSLK	ITEKVSGQHV	EIQAKYIGTT	IVVRQVGRYL	TFAVRMPEEV
VNAVEDWDSQ	GLYLCLRGCP	LNQQIDFQAF	HTNAEGTGAR	RLAAASPAPT
APETFPYETA	VAKCKEKLPV	EDLYYQACVF	DLLTTGDVNF	TLAAYYALED
VKMLHSNKDK	LHLYDRTRDL	PGRAAAGLPL	APRPLLGALV	PLLALLPVFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hata K., Kaibuchi K., Inagaki S., Yamashita T. (2009). Unc5B associates with LARG to mediate the action of repulsive guidance molecule. J. Cell Biol. 184: 737—750. PMID 19273616 DOI:10.1083/jcb.200807029
Endo M., Yamashita T. (2009). Inactivation of Ras by p120GAP via focal adhesion kinase dephosphorylation mediates RGMa-induced growth cone collapse. J. Neurosci. 29: 6649—6662. PMID 19458235 DOI:10.1523/JNEUROSCI.0927-09.2009

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30308 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96B86 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.