RNF213 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | RNF213, ALO17, C17orf27, KIAA1618, MYMY2, MYSTR, NET57, ring finger protein 213 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613768 MGI: 1289196 HomoloGene: 45439 GeneCards: RNF213 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity • ATPase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of non-canonical Wnt signaling pathway • Ангіогенез • sprouting angiogenesis • protein homooligomerization • protein autoubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • protein polyubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001256071 NM_020914 NM_020954 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 80.26 – 80.4 Mb | Хр. 11: 119.28 – 119.38 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RNF213 (англ. Ring finger protein 213) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 5 207 амінокислот, а молекулярна маса — 591 407[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MECPSCQHVS | | KEETPKFCSQ | | CGERLPPAAP | | IADSENNNST | | MASASEGEME |
CGQELKEEGG | | PCLFPGSDSW | | QENPEEPCSK | | ASWTVQESKK | | KKRKKKKKGN |
KSASSELASL | | PLSPASPCHL | | TLLSNPWPQD | | TALPHSQAQQ | | SGPTGQPSQP |
PGTATTPLEG | | DGLSAPTEVG | | DSPLQAQALG | | EAGVATGSEA | | QSSPQFQDHT |
EGEDQDASIP | | SGGRGLSQEG | | TGPPTSAGEG | | HSRTEDAAQE | | LLLPESKGGS |
SEPGTELQTT | | EQQAGASASM | | AVDAVAEPAN | | AVKGAGKEMK | | EKTQRMKQPP |
ATTPPFKTHC | | QEAETKTKDE | | MAAAEEKVGK | | NEQGEPEDLK | | KPEGKNRSAA |
AVKNEKEQKN | | QEADVQEVKA | | STLSPGGGVT | | VFFHAIISLH | | FPFNPDLHKV |
FIRGGEEFGE | | SKWDSNICEL | | HYTRDLGHDR | | VLVEGIVCIS | | KKHLDKYIPY |
KYVIYNGESF | | EYEFIYKHQQ | | KKGEYVNRCL | | FIKSSLLGSG | | DWHQYYDIVY |
MKPHGRLQKV | | MNHITDGPRK | | DLVKGKQIAA | | ALMLDSTFSI | | LQTWDTINLN |
SFFTQFEQFC | | FVLQQPMIYE | | GQAQLWTDLQ | | YREKEVKRYL | | WQHLKKHVVP |
LPDGKSTDFL | | PVDCPVRSKL | | KTGLIVLFVV | | EKIELLLEGS | | LDWLCHLLTS |
DASSPDEFHR | | DLSHILGIPQ | | SWRLYLVNLC | | QRCMDTRTYT | | WLGALPVLHC |
CMELAPRHKD | | AWRQPEDTWA | | ALEGLSFSPF | | REQMLDTSSL | | LQFMREKQHL |
LSIDEPLFRS | | WFSLLPLSHL | | VMYMENFIEH | | LGRFPAHILD | | CLSGIYYRLP |
GLEQVLNTQD | | VQDVQNVQNI | | LEMLLRLLDT | | YRDKIPEEAL | | SPSYLTVCLK |
LHEAICSSTK | | LLKFYELPAL | | SAEIVCRMIR | | LLSLVDSAGQ | | RDETGNNSVQ |
TVFQGTLAAT | | KRWLREVFTK | | NMLTSSGASF | | TYVKEIEVWR | | RLVEIQFPAE |
HGWKESLLGD | | MEWRLTKEEP | | LSQITAYCNS | | CWDTKGLEDS | | VAKTFEKCII |
EAVSSACQSQ | | TSILQGFSYS | | DLRKFGIVLS | | AVITKSWPRT | | ADNFNDILKH |
LLTLADVKHV | | FRLCGTDEKI | | LANVTEDAKR | | LIAVADSVLT | | KVVGDLLSGT |
ILVGQLELII | | KHKNQFLDIW | | QLREKSLSPQ | | DEQCAVEEAL | | DWRREELLLL |
KKEKRCVDSL | | LKMCGNVKHL | | IQVDFGVLAV | | RHSQDLSSKR | | LNDTVTVRLS |
TSSNSQRATH | | YHLSSQVQEM | | AGKIDLLRDS | | HIFQLFWREA | | AEPLSEPKED |
QEAAELLSEP | | EEESERHILE | | LEEVYDYLYQ | | PSYRKFIKLH | | QDLKSGEVTL |
AEIDVIFKDF | | VNKYTDLDSE | | LKIMCTVDHQ | | DQRDWIKDRV | | EQIKEYHHLH |
QAVHAAKVIL | | QVKESLGLNG | | DFSVLNTLLN | | FTDNFDDFRR | | ETLDQINQEL |
IQAKKLLQDI | | SEARCKGLQA | | LSLRKEFICW | | VREALGGINE | | LKVFVDLASI |
SAGENDIDVD | | RVACFHDAVQ | | GYASLLFKLD | | PSVDFSAFMK | | HLKKLWKALD |
KDQYLPRKLC | | DSARNLEWLK | | TVNESHGSVE | | RSSLTLATAI | | NQRGIYVIQA |
PKGGQKISPD | | TVLHLILPES | | PGSHEESREY | | SLEEVKELLN | | KLMLMSGKKD |
RNNTEVERFS | | EVFCSVQRLS | | QAFIDLHSAG | | NMLFRTWIAM | | AYCSPKQGVS |
LQMDFGLDLV | | TELKEGGDVT | | ELLAALCRQM | | EHFLDSWKRF | | VTQKRMEHFY |
LNFYTAEQLV | | YLSTELRKQP | | PSDAALTMLS | | FIKSNCTLRD | | VLRASVGCGS |
EAARYRMRRV | | MEELPLMLLS | | EFSLVDKLRI | | IMEQSMRCLP | | AFLPDCLDLE |
TLGHCLAHLA | | GMGGSPVERC | | LPRGLQVGQP | | NLVVCGHSEV | | LPAALAVYMQ |
TPSQPLPTYD | | EVLLCTPATT | | FEEVALLLRR | | CLTLGSLGHK | | VYSLLFADQL |
SYEVARQAEE | | LFHNLCTQQH | | REDYQLVMVC | | DGDWEHCYLP | | SAFSQHKVFV |
TPQAPLEAIQ | | AYLAGHYRVP | | KQTLSAAAVF | | NDRLCVGIVA | | SERAGVGKSL |
YVKRLHDKMK | | MQLNVKNVPL | | KTIRLIDPQV | | DESRVLGALL | | PFLDAQYQKV |
PVLFHLDVTS | | SVQTGIWVFL | | FKLLILQYLM | | DINGKMWLRN | | PCHLYIVEIL |
ERRTSVPSRS | | SSALRTRVPQ | | FSFLDIFPKV | | TCRPPKEVID | | MELSALRSDT |
EPGMDLWEFC | | SETFQRPYQY | | LRRFNQNQDL | | DTFQYQEGSV | | EGTPEECLQH |
FLFHCGVINP | | SWSELRNFAR | | FLNYQLRDCE | | ASLFCNPSFI | | GDTLRGFKKF |
VVTFMIFMAR | | DFATPSLHTS | | DQSPGKHMVT | | MDGVREEDLA | | PFSLRKRWES |
EPHPYVFFND | | DHTTMTFIGF | | HLQPNINGSV | | DAISHLTGKV | | IKRDVMTRDL |
YQGLLLQRVP | | FNVDFDKLPR | | HKKLERLCLT | | LGIPQATDPD | | KTYELTTDNM |
LKILAIEMRF | | RCGIPVIIMG | | ETGCGKTRLI | | KFLSDLRRGG | | TNADTIKLVK |
VHGGTTADMI | | YSRVREAENV | | AFANKDQHQL | | DTILFFDEAN | | TTEAISCIKE |
VLCDHMVDGQ | | PLAEDSGLHI | | IAACNPYRKH | | SEEMICRLES | | AGLGYRVSME |
ETADRLGSIP | | LRQLVYRVHA | | LPPSLIPLVW | | DFGQLSDVAE | | KLYIQQIVQR |
LVESISLDEN | | GTRVITEVLC | | ASQGFMRKTE | | DECSFVSLRD | | VERCVKVFRW |
FHEHSAMLLA | | QLNAFLSKSS | | VSKNHTERDP | | VLWSLMLAIG | | VCYHASLEKK |
DSYRKAIARF | | FPKPYDDSRL | | LLDEITRAQD | | LFLDGVPLRK | | TIAKNLALKE |
NVFMMVVCIE | | LKIPLFLVGK | | PGSSKSLAKT | | IVADAMQGPA | | AYSDLFRSLK |
QVHLVSFQCS | | PHSTPQGIIS | | TFRQCARFQQ | | GKDLQQYVSV | | VVLDEVGLAE |
DSPKMPLKTL | | HPLLEDGCIE | | DDPAPHKKVG | | FVGISNWALD | | PAKMNRGIFV |
SRGSPNETEL | | IESAKGICSS | | DILVQDRVQG | | YFASFAKAYE | | TVCKRQDKEF |
FGLRDYYSLI | | KMVFAAAKAS | | NRKPSPQDIA | | QAVLRNFSGK | | DDIQALDIFL |
ANLPEAKCSE | | EVSPMQLIKQ | | NIFGPSQKVP | | GGEQEDAESR | | YLLVLTKNYV |
ALQILQQTFF | | EGDQQPEIIF | | GSGFPKDQEY | | TQLCRNINRV | | KICMETGKMV |
LLLNLQNLYE | | SLYDALNQYY | | VHLGGQKYVD | | LGLGTHRVKC | | RVHPNFRLIV |
IEEKDVVYKH | | FPIPLINRLE | | KHYLDINTVL | | EKWQKSIVEE | | LCAWVEKFIN |
VKAHHFQKRH | | KYSPSDVFIG | | YHSDACASVV | | LQVIERQGPR | | ALTEELHQKV |
SEEAKSILLN | | CATPDAVVRL | | SAYSLGGFAA | | EWLSQEYFHR | | QRHNSFADFL |
QAHLHTADLE | | RHAIFTEITT | | FSRLLTSHDC | | EILESEVTGR | | APKPTLLWLQ |
QFDTEYSFLK | | EVRNCLTNTA | | KCKILIFQTD | | FEDGIRSAQL | | IASAKYSVIN |
EINKIRENED | | RIFVYFITKL | | SRVGRGTAYV | | GFHGGLWQSV | | HIDDLRRSTL |
MVSDVTRLQH | | VTISQLFAPG | | DLPELGLEHR | | AEDGHEEAME | | TEASTSGEVA |
EVAEEAMETE | | SSEKVGKETS | | ELGGSDVSIL | | DTTRLLRSCV | | QSAVGMLRDQ |
NESCTRNMRR | | VVLLLGLLNE | | DDACHASFLR | | VSKMRLSVFL | | KKQEESQFHP |
LEWLAREACN | | QDALQEAGTF | | RHTLWKRVQG | | AVTPLLASMI | | SFIDRDGNLE |
LLTRPDTPPW | | ARDLWMFIFS | | DTMLLNIPLV | | MNNERHKGEM | | AYIVVQNHMN |
LSENASNNVP | | FSWKIKDYLE | | ELWVQAQYIT | | DAEGLPKKFV | | DIFQQTPLGR |
FLAQLHGEPQ | | QELLQCYLKD | | FILLTMRVST | | EEELKFLQMA | | LWSCTRKLKA |
ASEAPEEEVS | | LPWVHLAYQR | | FRSRLQNFSR | | ILTIYPQVLH | | SLMEARWNHE |
LAGCEMTLDA | | FAAMACTEML | | TRNTLKPSPQ | | AWLQLVKNLS | | MPLELICSDE |
HMQGSGSLAQ | | AVIREVRAQW | | SRIFSTALFV | | EHVLLGTESR | | VPELQGLVTE |
HVFLLDKCLR | | ENSDVKTHGP | | FEAVMRTLCE | | CKETASKTLS | | RFGIQPCSIC |
LGDAKDPVCL | | PCDHVHCLRC | | LRAWFASEQM | | ICPYCLTALP | | DEFSPAVSQA |
HREAIEKHAR | | FRQMCNSFFV | | DLVSTICFKD | | NAPPEKEVIE | | SLLSLLFVQK |
GRLRDAAQRH | | CEHTKSLSPF | | NDVVDKTPVI | | RSVILKLLLK | | YSFHDVKDYI |
QEYLTLLKKK | | AFITEDKTEL | | YMLFINCLED | | SILEKTSAYS | | RNDELNHLEE |
EGRFLKAYSP | | ASRGREPANE | | ASVEYLQEVA | | RIRLCLDRAA | | DFLSEPEGGP |
EMAKEKQCYL | | QQVKQFCIRV | | ENDWHRVYLV | | RKLSSQRGME | | FVQGLSKPGR |
PHQWVFPKDV | | VKQQGLRQDH | | PGQMDRYLVY | | GDEYKALRDA | | VAKAVLECKP |
LGIKTALKAC | | KTPQSQQSAY | | FLLTLFREVA | | ILYRSHNASL | | HPTPEQCEAV |
SKFIGECKIL | | SPPDISRFAT | | SLVDNSVPLL | | RAGPSDSNLD | | GTVTEMAIHA |
AAVLLCGQNE | | LLEPLKNLAF | | SPATMAHAFL | | PTMPEDLLAQ | | ARRWKGLERV |
HWYTCPNGHP | | CSVGECGRPM | | EQSICIDCHA | | PIGGIDHKPR | | DGFHLVKDKA |
DRTQTGHVLG | | NPQRRDVVTC | | DRGLPPVVFL | | LIRLLTHLAL | | LLGASQSSQA |
LINIIKPPVR | | DPKGFLQQHI | | LKDLEQLAKM | | LGHSADETIG | | VVHLVLRRLL |
QEQHQLSSRR | | LLNFDTELST | | KEMRNNWEKE | | IAAVISPELE | | HLDKTLPTMN |
NLISQDKRIS | | SNPVAKIIYG | | DPVTFLPHLP | | RKSVVHCSKI | | WSCRKRITVE |
YLQHIVEQKN | | GKERVPILWH | | FLQKEAELRL | | VKFLPEILAL | | QRDLVKQFQN |
VQQVEYSSIR | | GFLSKHSSDG | | LRQLLHNRIT | | VFLSTWNKLR | | RSLETNGEIN |
LPKDYCSTDL | | DLDTEFEILL | | PRRRGLGLCA | | TALVSYLIRL | | HNEIVYAVEK |
LSKENNSYSV | | DAAEVTELHV | | ISYEVERDLT | | PLILSNCQYQ | | VEEGRETVQE |
FDLEKIQRQI | | VSRFLQGKPR | | LSLKGIPTLV | | YRHDWNYEHL | | FMDIKNKMAQ |
DSLPSSVISA | | ISGQLQSYSD | | ACEVLSVVEV | | TLGFLSTAGG | | DPNMQLNVYT |
QDILQMGDQT | | IHVLKALNRC | | QLKHTIALWQ | | FLSAHKSEQL | | LRLHKEPFGE |
ISSRYKADLS | | PENAKLLSTF | | LNQTGLDAFL | | LELHEMIILK | | LKNPQTQTEE |
RFRPQWSLRD | | TLVSYMQTKE | | SEILPEMASQ | | FPEEILLASC | | VSVWKTAAVL |
KWNREMR |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як ангіогенез, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- Danelishvili L., Yamazaki Y., Selker J., Bermudez L.E. (2010). Secreted Mycobacterium tuberculosis Rv3654c and Rv3655c proteins participate in the suppression of macrophage apoptosis. PLoS ONE. 5: E10474—E10474. PMID 20454556 DOI:10.1371/journal.pone.0010474
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14539 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q63HN8 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |