RPAIN : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

RPAIN

Ідентифікатори

Символи

RPAIN, HRIP, RIP, RPA interacting protein

Зовнішні ІД

OMIM: 617299 MGI: 1916973 HomoloGene: 13006 GeneCards: RPAIN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • PML body • клітинне ядро • fibrillar center
Біологічний процес	• DNA-dependent DNA replication • DNA recombination • response to UV • GO:0100026 Репарація ДНК • protein import into nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84268


69723

Ensembl


ENSG00000129197


ENSMUSG00000018449

UniProt


Q86UA6


Q9CWY9

RefSeq (мРНК)

NM_001033002 NM_001160243 NM_001160244 NM_001160246 NM_001160266
NM_001160267 NM_032308


NM_001252413 NM_001252414 NM_001252415 NM_027186

RefSeq (білок)


NP_001028174 NP_001153715 NP_001153716 NP_001153718 NP_001153738


NP_001239342 NP_001239343 NP_001239344 NP_081462

Локус (UCSC)

Хр. 17: 5.42 – 5.43 Mb

Хр. 11: 70.86 – 70.87 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RPAIN (англ. RPA interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 24 784^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAESLRSPRR	SLYKLVGSPP	WKEAFRQRCL	ERMRNSRDRL	LNRYRQAGSS
GPGNSQNSFL	VQEVMEEEWN	ALQSVENCPE	DLAQLEELID	MAVLEEIQQE
LIKQEQSIIS	EYEKSLQFDE	KCLSIMLAEW	EANPLICPVC	TKYNLRITSG
VVVCQCGLSI	PSHSSELTEQ	KLRACLEGSI	NEHSAHCPHT	PEFSVTGGTE
EKSSLLMSCL	ACDTWAVIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Park J., Seo T., Kim H., Choe J. (2005). Sumoylation of the novel protein hRIPbeta is involved in replication protein A deposition in PML nuclear bodies. Mol. Cell. Biol. 25: 8202—8214. PMID 16135809 DOI:10.1128/MCB.25.18.8202-8214.2005
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28641 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86UA6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.