SCARB1

SCARB1
Ідентифікатори
Символи SCARB1, CD36L1, CLA-1, CLA1, HDLQTL6, SR-BI, SRB1, scavenger receptor class B member 1
Зовнішні ІД OMIM: 601040 MGI: 893578 HomoloGene: 21132 GeneCards: SCARB1
Пов'язані генетичні захворювання
Рак нирки[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• apolipoprotein binding
• protein homodimerization activity
• virus receptor activity
• transporter activity
• high-density lipoprotein particle receptor activity
• phosphatidylserine binding
• apolipoprotein A-I binding
• lipopolysaccharide binding
• low-density lipoprotein particle binding
• 1-phosphatidylinositol binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• high-density lipoprotein particle binding
• lipopolysaccharide immune receptor activity
• amyloid-beta binding
• scavenger receptor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• endocytic vesicle membrane
• внутрішньоклітинна мембранна органела
• мембрана
• клітинна мембрана
• integral component of plasma membrane
• cell surface
• lysosomal membrane
• caveola
• екзосома
• microvillus membrane

Біологічний процес

• cholesterol import
• positive regulation of triglyceride biosynthetic process
• regulation of phosphatidylcholine catabolic process
• recognition of apoptotic cell
• lipid transport
• low-density lipoprotein particle clearance
• blood vessel endothelial cell migration
• positive regulation of cholesterol storage
• phospholipid transport
• cholesterol transport
• Загоєння ран
• cholesterol catabolic process
• рецептор-опосередкований ендоцитоз
• high-density lipoprotein particle remodeling
• positive regulation of endothelial cell migration
• androgen biosynthetic process
• vitamin transmembrane transport
• positive regulation of nitric-oxide synthase activity
• endothelial cell proliferation
• GO:0015921 lipopolysaccharide transport
• cholesterol efflux
• phagocytosis, recognition
• viral entry into host cell
• intestinal absorption
• cholesterol homeostasis
• regulation of phagocytosis
• GO:0051856 adhesion of symbiont to host
• GO:0022415 viral process
• detection of lipopolysaccharide
• triglyceride homeostasis
• reverse cholesterol transport
• lipopolysaccharide-mediated signaling pathway
• high-density lipoprotein particle clearance

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
949
20778
Ensembl
ENSG00000073060
ENSMUSG00000037936
UniProt
Q8WTV0
Q61009
RefSeq (мРНК)
NM_005505
NM_001082959
NM_001205082
NM_001205083
NM_016741
RefSeq (білок)
NP_001076428
NP_005496
NP_001354910
NP_001354911
NP_001354912
NP_001354913
NP_001354914
NP_001354915
NP_001354916
NP_001354917
NP_001354918
NP_001192011
NP_001192012
NP_058021
Локус (UCSC) Хр. 12: 124.78 – 124.88 Mb Хр. 5: 125.35 – 125.42 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SCARB1 (англ. Scavenger receptor class B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 552 амінокислот, а молекулярна маса — 60 878[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGCSAKARWAAGALGVAGLLCAVLGAVMIVMVPSLIKQQVLKNVRIDPSS
LSFNMWKEIPIPFYLSVYFFDVMNPSEILKGEKPQVRERGPYVYREFRHK
SNITFNNNDTVSFLEYRTFQFQPSKSHGSESDYIVMPNILVLGAAVMMEN
KPMTLKLIMTLAFTTLGERAFMNRTVGEIMWGYKDPLVNLINKYFPGMFP
FKDKFGLFAELNNSDSGLFTVFTGVQNISRIHLVDKWNGLSKVDFWHSDQ
CNMINGTSGQMWPPFMTPESSLEFYSPEACRSMKLMYKESGVFEGIPTYR
FVAPKTLFANGSIYPPNEGFCPCLESGIQNVSTCRFSAPLFLSHPHFLNA
DPVLAEAVTGLHPNQEAHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYMKSVAGI
GQTGKIEPVVLPLLWFAESGAMEGETLHTFYTQLVLMPKVMHYAQYVLLA
LGCVLLLVPVICQIRSQVGAGQRAARADSHSLACWGKGASDRTLWPTAAW
SPPPAAVLRLCRSGSGHCWGLRSTLASFACRVATTLPVLEGLGPSLGGGT
GS

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kawasaki Y., Nakagawa A., Nagaosa K., Shiratsuchi A., Nakanishi Y. (2002). Phosphatidylserine binding of class B scavenger receptor type I, a phagocytosis receptor of testicular Sertoli cells. J. Biol. Chem. 277: 27559—27566. PMID 12016218 DOI:10.1074/jbc.M202879200
  • Philips J.A., Rubin E.J., Perrimon N. (2005). Drosophila RNAi screen reveals CD36 family member required for mycobacterial infection. Science. 309: 1251—1253. PMID 16020694 DOI:10.1126/science.1116006
  • Calvo D., Vega M. (1993). Identification, primary structure and distribution of CLA-1, a novel member of the CD36/LIMPII gene family. J. Biol. Chem. 268: 18929—18935. PMID 7689561
  • Webb N.R., de Villiers W.J., Connell P.M., de Beer F.C., van der Westhuyzen D.R. (1997). Alternative forms of the scavenger receptor BI (SR-BI). J. Lipid Res. 38: 1490—1495. PMID 9254074

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1664 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. ↑ UniProt, Q8WTV0 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»