SDK2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1WF5, 1WFN, 1WFO, 1WIS

Ідентифікатори

Символи

SDK2, sidekick cell adhesion molecule 2

Зовнішні ІД

OMIM: 607217 MGI: 2443847 HomoloGene: 10406 GeneCards: SDK2

Пов'язані генетичні захворювання

панічний розлад^[1]

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54549


237979

Ensembl


ENSG00000069188


ENSMUSG00000041592

UniProt


Q58EX2


Q6V4S5

RefSeq (мРНК)


NM_001144952 NM_019064


NM_172800

RefSeq (білок)


NP_001138424


NP_766388

Локус (UCSC)

Хр. 17: 73.33 – 73.64 Mb

Хр. 11: 113.67 – 113.96 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SDK2 (англ. Sidekick cell adhesion molecule 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 172 амінокислот, а молекулярна маса — 239 396^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWGLLIWTLL	ALHQIRAARA	QDDVSPYFKT	EPVRTQVHLE	GNRLVLTCMA
EGSWPLEFKW	LHNNRELTKF	SLEYRYMITS	LDRTHAGFYR	CIVRNRMGAL
LQRQTEVQVA	YMGSFEEGEK	HQSVSHGEAA	VIRAPRIASF	PQPQVTWFRD
GRKIPPSSRI	AITLENTLVI	LSTVAPDAGR	YYVQAVNDKN	GDNKTSQPIT
LTVENVGGPA	DPIAPTIIIP	PKNTSVVAGT	SEVTLECVAN	ARPLIKLHII
WKKDGVLLSG	GISDHNRRLT	IPNPTGSDAG	YYECEAVLRS	SSVPSVVRGA
YLSVLEPPQF	VKEPERHITA	EMEKVVDIPC	QAKGVPPPSI	TWYKDAAVVE
VEKLTRFRQR	NDGGLQISGL	VPDDTGMFQC	FARNAAGEVQ	TSTYLAVTSI
APNITRGPLD	STVIDGMSVV	LACETSGAPR	PAITWQKGER	ILASGSVQLP
RFTPLESGSL	LISPTHISDA	GTYTCLATNS	RGVDEASADL	VVWARTRITK
PPQDQSVIKG	TQASMVCGVT	HDPRVTIRYI	WEKDGATLGT	ESHPRIRLDR
NGSLHISQTW	SGDIGTYTCR	VISAGGNDSR	SAHLRVRQLP	HAPEHPVATL
STVERRAINL	TWTKPFDGNS	PLIRYILEMS	ENNAPWTVLL	ASVDPKATSV
TVKGLVPARS	YQFRLCAVND	VGKGQFSKDT	ERVSLPEEPP	TAPPQNVIAS
GRTNQSIMIQ	WQPPPESHQN	GILKGYIIRY	CLAGLPVGYQ	FKNITDADVN
NLLLEDLIIW	TNYEIEVAAY	NSAGLGVYSS	KVTEWTLQGV	PTVPPGNVHA
EATNSTTIRF	TWNAPSPQFI	NGINQGYKLI	AWEPEQEEEV	TMVTARPNFQ
DSIHVGFVSG	LKKFTEYFTS	VLCFTTPGDG	PRSTPQLVRT	HEDVPGPVGH
LSFSEILDTS	LKVSWQEPGE	KNGILTGYRI	SWEEYNRTNT	RVTHYLPNVT
LEYRVTGLTA	LTTYTIEVAA	MTSKGQGQVS	ASTISSGVPP	ELPGPPTNLG
ISNIGPRSVT	LQFRPGYDGK	TSISRWLVEA	QVGVVGEGEE	WLLIHQLSNE
PDARSMEVPD	LNPFTCYSFR	MRQVNIVGTS	PPSQPSRKIQ	TLQAPPDMAP
ANVSLRTASE	TSLWLRWMPL	PEMEYNGNPE	SVGYKIKYSR	SDGHGKTLSH
VVQDRVERDY	TIEDLEEWTE	YRVQVQAFNA	IGSGPWSQTV	VGRTRESVPS
SGPTNVSALA	TTSSSMLVRW	SEVPEADRNG	LVLGYKVMYK	EKDSDTQPRF
WLVEGNSSRS	AQLTGLGKYV	LYEVQVLAFT	RIGDGSPSHP	PILERTLDDV
PGPPMGILFP	EVRTTSVRLI	WQPPAAPNGI	ILAYQITHRL	NTTTANTATV
EVLAPSARQY	TATGLKPESV	YLFRITAQTR	KGWGEAAEAL	VVTTEKRDRP
QPPSRPMVQQ	EDVRARSVLL	SWEPGSDGLS	PVRYYTIQTR	ELPSGRWALH
SASVSHNASS	FIVDRLKPFT	SYKFRVKATN	DIGDSEFSEE	SESLTTLQAA
PDEAPTILSV	TPHTTTSVLI	RWQPPAEDKI	NGILLGFRIR	YRELLYEGLR
GFTLRGINNP	GATWAELTSM	YSMRNLSRPS	LTQYELDNLN	KHRRYEIRMS
VYNAVGEGPS	SPPQEVFVGE	AVPTAAPRNV	VVHGATATQL	DVTWEPPPLD
SQNGDIQGYK	IYFWEAQRGN	LTERVKTLFL	AENSVKLKNL	TGYTAYMVSV
AAFNAAGDGP	RSTPTQGQTQ	QAAPSAPSSV	KFSELTTTSV	NVSWEAPQFP
NGILEGYRLV	YEPCSPVDGV	SKIVTVDVKG	NSPLWLKVKD	LAEGVTYRFR
IRAKTFTYGP	EIEANVTTGP	GEGAPGPPGV	PIIVRYSSAI	AIHWSSGDPG
KGPITRYVIE	ARPSDEGLWD	ILIKDIPKEV	SSYTFSMDIL	KPGVSYDFRV
IAVNDYGFGT	PSSPSQSVPA	QKANPFYEEW	WFLVVIALVG	LIFILLLVFV
LIIRGQSKKY	AKKTDSGNSA	KSGALGHSEM	MSLDESSFPA	LELNNRRLSV
KNSFCRKNGL	YTRSPPRPSP	GSLHYSDEDV	TKYNDLIPAE	SSSLTEKPSE
ISDSQGSDSE	YEVDSNHQKA	HSFVNHYISD	PTYYNSWRRQ	QKGISRAQAY
SYTESDSGEP	DHTTVTNSTS	TQQGSLFRPK	ASRTPTPQNP	PNPPSQQSTL
YRPPSSLAPG	SRAPIAGFSS	FV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SDK2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19308 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q58EX2 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.