SECTM1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SECTM1

Ідентифікатори

Символи

SECTM1, K12, secreted and transmembrane 1, SECTM

Зовнішні ІД

OMIM: 602602 MGI: 2384805 HomoloGene: 134112 GeneCards: SECTM1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity • cytokine activity
Клітинна компонента	• extracellular region • комплекс Ґольджі • клітинна мембрана • мембрана • екзосома • integral component of membrane • міжклітинний простір
Біологічний процес	• mesoderm development • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6398


209588

Ensembl


ENSG00000141574


ENSMUSG00000025165

UniProt


Q8WVN6


Q921W8

RefSeq (мРНК)


NM_003004


NM_145373

RefSeq (білок)


NP_002995


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 17: 82.32 – 82.33 Mb

Хр. 11: 120.96 – 120.97 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SECTM1 (англ. Secreted and transmembrane 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 27 039^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQTCPLAFPG	HVSQALGTLL	FLAASLSAQN	EGWDSPICTE	GVVSVSWGEN
TVMSCNISNA	FSHVNIKLRA	HGQESAIFNE	VAPGYFSRDG	WQLQVQGGVA
QLVIKGARDS	HAGLYMWHLV	GHQRNNRQVT	LEVSGAEPQS	APDTGFWPVP
AVVTAVFILL	VALVMFAWYR	CRCSQQRREK	KFFLLEPQMK	VAALRAGAQQ
GLSRASAELW	TPDSEPTPRP	LALVFKPSPL	GALELLSPQP	LFPYAADP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Slentz-Kesler K.A., Hale L.P., Kaufman R.E. (1998). Identification and characterization of K12 (SECTM1), a novel human gene that encodes a Golgi-associated protein with transmembrane and secreted isoforms. Genomics. 47: 327—340. PMID 9480746 DOI:10.1006/geno.1997.5151
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lyman S.D., Escobar S., Rousseau A.-M., Armstrong A., Fanslow W.C. (2000). Identification of CD7 as a cognate of the human K12 (SECTM1) protein. J. Biol. Chem. 275: 3431—3437. PMID 10652336 DOI:10.1074/jbc.275.5.3431

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10707 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WVN6 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.