SEMA4B

Ідентифікатори

Символи

SEMA4B, SEMAC, SemC, semaphorin 4B

Зовнішні ІД

OMIM: 617029 MGI: 107559 HomoloGene: 8426 GeneCards: SEMA4B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• neuropilin binding • semaphorin receptor binding • chemorepellent activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • міжклітинний простір • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane
Біологічний процес	• multicellular organism development • диференціація клітин • нейробіологія розвитку • negative chemotaxis • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10509


20352

Ensembl


ENSG00000185033


ENSMUSG00000030539

UniProt


Q9NPR2


Q62179

RefSeq (мРНК)

NM_020210 NM_198925 NM_001324029 NM_001324030 NM_001324031
NM_001324032 NM_001324034 NM_001393916


NM_013659 NM_001360135

RefSeq (білок)

NP_001310958 NP_001310959 NP_001310960 NP_001310961 NP_001310962
NP_001310963 NP_064595 NP_945119


NP_038687 NP_001347064

Локус (UCSC)

Хр. 15: 90.16 – 90.23 Mb

Хр. 7: 79.84 – 79.88 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEMA4B (англ. Semaphorin 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 832 амінокислот, а молекулярна маса — 92 193^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLRSWLAAP	WGALPPRPPL	LLLLLLLLLL	QPPPPTWALS	PRISLPLGSE
ERPFLRFEAE	HISNYTALLL	SRDGRTLYVG	AREALFALSS	NLSFLPGGEY
QELLWGADAE	KKQQCSFKGK	DPQRDCQNYI	KILLPLSGSH	LFTCGTAAFS
PMCTYINMEN	FTLARDEKGN	VLLEDGKGRC	PFDPNFKSTA	LVVDGELYTG
TVSSFQGNDP	AISRSQSLRP	TKTESSLNWL	QDPAFVASAY	IPESLGSLQG
DDDKIYFFFS	ETGQEFEFFE	NTIVSRIARI	CKGDEGGERV	LQQRWTSFLK
AQLLCSRPDD	GFPFNVLQDV	FTLSPSPQDW	RDTLFYGVFT	SQWHRGTTEG
SAVCVFTMKD	VQRVFSGLYK	EVNRETQQWY	TVTHPVPTPR	PGACITNSAR
ERKINSSLQL	PDRVLNFLKD	HFLMDGQVRS	RMLLLQPQAR	YQRVAVHRVP
GLHHTYDVLF	LGTGDGRLHK	AVSVGPRVHI	IEELQIFSSG	QPVQNLLLDT
HRGLLYAASH	SGVVQVPMAN	CSLYRSCGDC	LLARDPYCAW	SGSSCKHVSL
YQPQLATRPW	IQDIEGASAK	DLCSASSVVS	PSFVPTGEKP	CEQVQFQPNT
VNTLACPLLS	NLATRLWLRN	GAPVNASASC	HVLPTGDLLL	VGTQQLGEFQ
CWSLEEGFQQ	LVASYCPEVV	EDGVADQTDE	GGSVPVIIST	SRVSAPAGGK
ASWGADRSYW	KEFLVMCTLF	VLAVLLPVLF	LLYRHRNSMK	VFLKQGECAS
VHPKTCPVVL	PPETRPLNGL	GPPSTPLDHR	GYQSLSDSPP	GSRVFTESEK
RPLSIQDSFV	EVSPVCPRPR	VRLGSEIRDS	VV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10730 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NPR2 (англ.) . Архів оригіналу за 8 лютого 2017. Процитовано 11 вересня 2017.