SF3A2

Ідентифікатори

Символи

SF3A2, PRP11, PRPF11, SAP62, SF3a66, splicing factor 3a subunit 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600796 MGI: 104912 HomoloGene: 136815 GeneCards: SF3A2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding
Клітинна компонента	• nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • small nuclear ribonucleoprotein complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • positive regulation of neuron projection development • spliceosomal complex assembly • U2-type prespliceosome assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8175


20222

Ensembl


ENSG00000104897


ENSMUSG00000020211

UniProt


Q15428


Q62203

RefSeq (мРНК)


NM_007165


NM_013651

RefSeq (білок)


NP_009096


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 19: 2.24 – 2.25 Mb

Хр. 10: 80.63 – 80.64 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SF3A2 (англ. Splicing factor 3a subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 464 амінокислот, а молекулярна маса — 49 256^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFQHRPGGK	TGSGGVASSS	ESNRDRRERL	RQLALETIDI	NKDPYFMKNH
LGSYECKLCL	TLHNNEGSYL	AHTQGKKHQT	NLARRAAKEA	KEAPAQPAPE
KVKVEVKKFV	KIGRPGYKVT	KQRDSEMGQQ	SLLFQIDYPE	IAEGIMPRHR
FMSAYEQRIE	PPDRRWQYLL	MAAEPYETIA	FKVPSREIDK	AEGKFWTHWN
RETKQFFLQF	HFKMEKPPAP	PSLPAGPPGV	KRPPPPLMNG	LPPRPPLPES
LPPPPPGGLP	LPPMPPTGPA	PSGPPGPPQL	PPPAPGVHPP	APVVHPPASG
VHPPAPGVHP	PAPGVHPPAP	GVHPPTSGVH	PPAPGVHPPA	PGVHPPAPGV
HPPAPGVHPP	APGVHPPPSA	GVHPQAPGVH	PAAPAVHPQA	PGVHPPAPGM
HPQAPGVHPQ	PPGVHPSAPG	VHPQPPGVHP	SNPGVHPPTP	MPPMLRPPLP
SEGPGNIPPP	PPTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Bennett M., Reed R. (1993). Correspondence between a mammalian spliceosome component and an essential yeast splicing factor. Science. 262: 105—108. PMID 8211113 DOI:10.1126/science.8211113
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10766 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15428 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.