SF3A2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SF3A2, PRP11, PRPF11, SAP62, SF3a66, splicing factor 3a subunit 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600796 MGI: 104912 HomoloGene: 136815 GeneCards: SF3A2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • small nuclear ribonucleoprotein complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • positive regulation of neuron projection development • spliceosomal complex assembly • U2-type prespliceosome assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a9/PBB_GE_SF3A2_37462_i_at_fs.png/250px-PBB_GE_SF3A2_37462_i_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d5/PBB_GE_SF3A2_209381_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SF3A2_209381_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 2.24 – 2.25 Mb | Хр. 10: 80.63 – 80.64 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SF3A2 (англ. Splicing factor 3a subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 464 амінокислот, а молекулярна маса — 49 256[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDFQHRPGGK | | TGSGGVASSS | | ESNRDRRERL | | RQLALETIDI | | NKDPYFMKNH |
LGSYECKLCL | | TLHNNEGSYL | | AHTQGKKHQT | | NLARRAAKEA | | KEAPAQPAPE |
KVKVEVKKFV | | KIGRPGYKVT | | KQRDSEMGQQ | | SLLFQIDYPE | | IAEGIMPRHR |
FMSAYEQRIE | | PPDRRWQYLL | | MAAEPYETIA | | FKVPSREIDK | | AEGKFWTHWN |
RETKQFFLQF | | HFKMEKPPAP | | PSLPAGPPGV | | KRPPPPLMNG | | LPPRPPLPES |
LPPPPPGGLP | | LPPMPPTGPA | | PSGPPGPPQL | | PPPAPGVHPP | | APVVHPPASG |
VHPPAPGVHP | | PAPGVHPPAP | | GVHPPTSGVH | | PPAPGVHPPA | | PGVHPPAPGV |
HPPAPGVHPP | | APGVHPPPSA | | GVHPQAPGVH | | PAAPAVHPQA | | PGVHPPAPGM |
HPQAPGVHPQ | | PPGVHPSAPG | | VHPQPPGVHP | | SNPGVHPPTP | | MPPMLRPPLP |
SEGPGNIPPP | | PPTN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- Bennett M., Reed R. (1993). Correspondence between a mammalian spliceosome component and an essential yeast splicing factor. Science. 262: 105—108. PMID 8211113 DOI:10.1126/science.8211113
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10766 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q15428 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |