SGSM2

Ідентифікатори

Символи

SGSM2, RUTBC1, small G protein signaling modulator 2

Зовнішні ІД

OMIM: 611418 MGI: 2144695 HomoloGene: 14780 GeneCards: SGSM2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• система ендомембран • цитоплазма • Меланосома
Біологічний процес	• late endosome to Golgi transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9905


97761

Ensembl


ENSG00000141258


ENSMUSG00000038351

UniProt


O43147


Q80U12

RefSeq (мРНК)


NM_001098509 NM_014853 NM_001346700


NM_197943 NM_001374688

RefSeq (білок)


NP_001091979 NP_001333629 NP_055668


NP_922934 NP_001361617

Локус (UCSC)

Хр. 17: 2.34 – 2.38 Mb

Хр. 11: 74.74 – 74.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SGSM2 (англ. Small G protein signaling modulator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 006 амінокислот, а молекулярна маса — 113 285^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSAEDAVKE	KLLWNVKKEV	KQIMEEAVTR	KFVHEDSSHI	IALCGAVEAC
LLHQLRRRAA	GFLRSDKMAA	LFTKVGKTCP	VAGEICHKVQ	ELQQQAEGRK
PSGVSQEALR	RQGSASGKAP	ALSPQALKHV	WVRTALIEKV	LDKVVQYLAE
NCSKYYEKEA	LLADPVFGPI	LASLLVGPCA	LEYTKLKTAD	HYWTDPSADE
LVQRHRIRGP	PTRQDSPAKR	PALGIRKRHS	SGSASEDRLA	ACARECVESL
HQNSRTRLLY	GKNHVLVQPK	EDMEAVPGYL	SLHQSAESLT	LKWTPNQLMN
GTLGDSELEK	SVYWDYALVV	PFSQVVCIHC	HQQKSGGTLV	LVSQDGIQRP
PLHFPQGGHL	LSFLSCLENG	LLPRGQLEPP	LWTQQGKGKV	FPKLRKRSSI
RSVDMEEMGT	GRATDYVFRI	IYPGHRHEHN	AGDMIEMQGF	GPSLPAWHLE
PLCSQGSSCL	SCSSSSSPHA	TPSHCSCIPD	RLPLRLLCES	MKRQIVSRAF
YGWLAHCRHL	STVRTHLSAL	VHHSVIPPDR	PPGASAGLTK	DVWSKYQKDK
KNYKELELLR	QVYYGGIEHE	IRKDVWPFLL	GHYKFGMSKK	EMEQVDAVVA
ARYQQVLAEW	KACEVVVRQR	EREAHPATRT	KFSSGSSIDS	HVQRLIHRDS
TISNDVFISV	DDLEPPEPQD	PEDSRPKPEQ	EAGPGTPGTA	VVEQQHSVEF
DSPDSGLPSS	RNYSVASGIQ	SSLDEGQSVG	FEEEDGGGEE	GSSGPGPAAH
TLREPQDPSQ	EKPQAGELEA	GEELAAVCAA	AYTIELLDTV	ALNLHRIDKD
VQRCDRNYWY	FTPPNLERLR	DVMCSYVWEH	LDVGYVQGMC	DLLAPLLVTL
DNDQLAYSCF	SHLMKRMSQN	FPNGGAMDTH	FANMRSLIQI	LDSELFELMH
QNGDYTHFYF	CYRWFLLDFK	RELLYEDVFA	VWEVIWAARH	ISSEHFVLFI
ALALVEAYRE	IIRDNNMDFT	DIIKFFNERA	EHHDAQEILR	IARDLVHKVQ
MLIENK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nottingham R.M., Ganley I.G., Barr F.A., Lambright D.G., Pfeffer S.R. (2011). RUTBC1 protein, a Rab9A effector that activates GTP hydrolysis by Rab32 and Rab33B proteins. J. Biol. Chem. 286: 33213—33222. PMID 21808068 DOI:10.1074/jbc.M111.261115
Marubashi S., Shimada H., Fukuda M., Ohbayashi N. (2016). RUTBC1 functions as a GTPase-activating protein for Rab32/38 and regulates melanogenic enzyme trafficking in melanocytes. J. Biol. Chem. 291: 1427—1440. PMID 26620560 DOI:10.1074/jbc.M115.684043

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29026 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O43147 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.