SGTA

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2VYI, 4CPG, 4GOD, 4GOE, 4GOF

Ідентифікатори

Символи

SGTA, SGT, alphaSGT, hSGT, small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing alpha, small glutamine rich tetratricopeptide repeat co-chaperone alpha, SGT1, Vpu

Зовнішні ІД

OMIM: 603419 MGI: 1098703 HomoloGene: 31122 GeneCards: SGTA

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • BAT3 complex binding • protein self-association • identical protein binding • GO:0032947 molecular adaptor activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • presynapse • extrinsic component of synaptic vesicle membrane • TRC complex
Біологічний процес	• positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0022415 viral process • ubiquitin-dependent ERAD pathway • negative regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane • chaperone-mediated protein folding • posttranslational protein targeting to endoplasmic reticulum membrane • positive regulation of chaperone-mediated protein folding
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6449


52551

Ensembl


ENSG00000104969


ENSMUSG00000004937

UniProt


O43765


Q8BJU0

RefSeq (мРНК)


NM_003021


NM_024499 NM_001358549 NM_001358550

RefSeq (білок)


NP_003012


NP_078775 NP_001345478 NP_001345479

Локус (UCSC)

Хр. 19: 2.75 – 2.78 Mb

Хр. 10: 80.88 – 80.9 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SGTA (англ. Small glutamine rich tetratricopeptide repeat containing alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 34 063^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDNKKRLAYA	IIQFLHDQLR	HGGLSSDAQE	SLEVAIQCLE	TAFGVTVEDS
DLALPQTLPE	IFEAAATGKE	MPQDLRSPAR	TPPSEEDSAE	AERLKTEGNE
QMKVENFEAA	VHFYGKAIEL	NPANAVYFCN	RAAAYSKLGN	YAGAVQDCER
AICIDPAYSK	AYGRMGLALS	SLNKHVEAVA	YYKKALELDP	DNETYKSNLK
IAELKLREAP	SPTGGVGSFD	IAGLLNNPGF	MSMASNLMNN	PQIQQLMSGM
ISGGNNPLGT	PGTSPSQNDL	ASLIQAGQQF	AQQMQQQNPE	LIEQLRSQIR
SRTPSASNDD	QQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Liu F.H., Wu S.J., Hu S.M., Hsiao C.D., Wang C. (1999). Specific interaction of the 70-kDa heat shock cognate protein with the tetratricopeptide repeats. J. Biol. Chem. 274: 34425—34432. PMID 10567422 DOI:10.1074/jbc.274.48.34425
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liou S.T., Wang C. (2005). Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein is composed of three structural units with distinct functions. Arch. Biochem. Biophys. 435: 253—263. PMID 15708368 DOI:10.1016/j.abb.2004.12.020
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Boal F., Le Pevelen S., Cziepluch C., Scotti P., Lang J. (2007). Cysteine-string protein isoform beta (Cspbeta) is targeted to the trans-Golgi network as a non-palmitoylated CSP in clonal beta-cells. Biochim. Biophys. Acta. 1773: 109—119. PMID 17034881 DOI:10.1016/j.bbamcr.2006.08.054
Leznicki P., High S. (2012). SGTA antagonizes BAG6-mediated protein triage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 19214—19219. PMID 23129660 DOI:10.1073/pnas.1209997109

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10819 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O43765 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.