SIN3B |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d8/Protein_SIN3B_PDB_1e91.png/250px-Protein_SIN3B_PDB_1e91.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1E91, 1PD7, 2CR7, 2CZY, 2F05 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, SIN3 transcription regulator family member B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607777 MGI: 107158 HomoloGene: 81810 GeneCards: SIN3B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • X-хромосома • Y-хромосома • аутосома • Sin3 complex • нуклеоплазма • XY body • клітинне ядро • Хроматин |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • regulation of lipid metabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d1/PBB_GE_SIN3B_209352_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIN3B_209352_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1a/PBB_GE_SIN3B_39705_at_fs.png/250px-PBB_GE_SIN3B_39705_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001297595 NM_001297597 NM_015260 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001284524 NP_001284526 NP_056075 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 16.83 – 16.88 Mb | Хр. 8: 73.45 – 73.48 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SIN3B (англ. SIN3 transcription regulator family member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 133 066[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAHAGGGSGG | | SGAGGPAGRG | | LSGARWGRSG | | SAGHEKLPVH | | VEDALTYLDQ |
VKIRFGSDPA | | TYNGFLEIMK | | EFKSQSIDTP | | GVIRRVSQLF | | HEHPDLIVGF |
NAFLPLGYRI | | DIPKNGKLNI | | QSPLTSQENS | | HNHGDGAEDF | | KQQVPYKEDK |
PQVPLESDSV | | EFNNAISYVN | | KIKTRFLDHP | | EIYRSFLEIL | | HTYQKEQLNT |
RGRPFRGMSE | | EEVFTEVANL | | FRGQEDLLSE | | FGQFLPEAKR | | SLFTGNGPCE |
MHSVQKNEHD | | KTPEHSRKRS | | RPSLLRPVSA | | PAKKKMKLRG | | TKDLSIAAVG |
KYGTLQEFSF | | FDKVRRVLKS | | QEVYENFLRC | | IALFNQELVS | | GSELLQLVSP |
FLGKFPELFA | | QFKSFLGVKE | | LSFAPPMSDR | | SGDGISREID | | YASCKRIGSS |
YRALPKTYQQ | | PKCSGRTAIC | | KELDHWTLLQ | | GSWTDDYCMS | | KFKNTCWIPG |
YSAGVLNDTW | | VSFPSWSEDS | | TFVSSKKTPY | | EEQLHRCEDE | | RFELDVVLET |
NLATIRVLES | | VQKKLSRMAP | | EDQEKFRLDD | | SLGGTSEVIQ | | RRAIYRIYGD |
KAPEIIESLK | | KNPVTAVPVV | | LKRLKAKEEE | | WREAQQGFNK | | IWREQYEKAY |
LKSLDHQAVN | | FKQNDTKALR | | SKSLLNEIES | | VYDEHQEQHS | | EGRSAPSSEP |
HLIFVYEDRQ | | ILEDAAALIS | | YYVKRQPAIQ | | KEDQGTIHQL | | LHQFVPSLFF |
SQQLDLGASE | | ESADEDRDSP | | QGQTTDPSER | | KKPAPGPHSS | | PPEEKGAFGD |
APATEQPPLP | | PPAPHKPLDD | | VYSLFFANNN | | WYFFLRLHQT | | LCSRLLKIYR |
QAQKQLLEYR | | TEKEREKLLC | | EGRREKGSDP | | AMELRLKQPS | | EVELEEYYPA |
FLDMVRSLLE | | GSIDPTQYED | | TLREMFTIHA | | YVGFTMDKLV | | QNIARQLHHL |
VSDDVCLKVV | | ELYLNEKKRG | | AAGGNLSSRC | | VRAARETSYQ | | WKAERCMADE |
NCFKVMFLQR | | KGQVIMTIEL | | LDTEEAQTED | | PVEVQHLARY | | VEQYVGTEGA |
SSSPTEGFLL | | KPVFLQRNLK | | KFRRRWQSEQ | | ARALRGEARS | | SWKRLVGVES |
ACDVDCRFKL | | STHKMVFIVN | | SEDYMYRRGT | | LCRAKQVQPL | | VLLRHHQHFE |
EWHSRWLEDN | | VTVEAASLVQ | | DWLMGEEDED | | MVPCKTLCET | | VHVHGLPVTR |
YRVQYSRRPA | | SP |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
- Lalioti V.S., Vergarajauregui S., Villasante A., Pulido D., Sandoval I.V. (2013). C6orf89 encodes three distinct HDAC enhancers that function in the nucleolus, the Golgi and the midbody. J. Cell. Physiol. 228: 1907—1921. PMID 23460338 DOI:10.1002/jcp.24355
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19354 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75182 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |