SIN3B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1E91, 1PD7, 2CR7, 2CZY, 2F05

Ідентифікатори

Символи

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, SIN3 transcription regulator family member B

Зовнішні ІД

OMIM: 607777 MGI: 107158 HomoloGene: 81810 GeneCards: SIN3B

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • X-хромосома • Y-хромосома • аутосома • Sin3 complex • нуклеоплазма • XY body • клітинне ядро • Хроматин
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • regulation of lipid metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23309


20467

Ensembl


ENSG00000127511


ENSMUSG00000031622

UniProt


O75182


Q62141

RefSeq (мРНК)


NM_001297595 NM_001297597 NM_015260


NM_001113248 NM_009188

RefSeq (білок)


NP_001284524 NP_001284526 NP_056075


NP_001106719 NP_033214

Локус (UCSC)

Хр. 19: 16.83 – 16.88 Mb

Хр. 8: 73.45 – 73.48 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SIN3B (англ. SIN3 transcription regulator family member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 162 амінокислот, а молекулярна маса — 133 066^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHAGGGSGG	SGAGGPAGRG	LSGARWGRSG	SAGHEKLPVH	VEDALTYLDQ
VKIRFGSDPA	TYNGFLEIMK	EFKSQSIDTP	GVIRRVSQLF	HEHPDLIVGF
NAFLPLGYRI	DIPKNGKLNI	QSPLTSQENS	HNHGDGAEDF	KQQVPYKEDK
PQVPLESDSV	EFNNAISYVN	KIKTRFLDHP	EIYRSFLEIL	HTYQKEQLNT
RGRPFRGMSE	EEVFTEVANL	FRGQEDLLSE	FGQFLPEAKR	SLFTGNGPCE
MHSVQKNEHD	KTPEHSRKRS	RPSLLRPVSA	PAKKKMKLRG	TKDLSIAAVG
KYGTLQEFSF	FDKVRRVLKS	QEVYENFLRC	IALFNQELVS	GSELLQLVSP
FLGKFPELFA	QFKSFLGVKE	LSFAPPMSDR	SGDGISREID	YASCKRIGSS
YRALPKTYQQ	PKCSGRTAIC	KELDHWTLLQ	GSWTDDYCMS	KFKNTCWIPG
YSAGVLNDTW	VSFPSWSEDS	TFVSSKKTPY	EEQLHRCEDE	RFELDVVLET
NLATIRVLES	VQKKLSRMAP	EDQEKFRLDD	SLGGTSEVIQ	RRAIYRIYGD
KAPEIIESLK	KNPVTAVPVV	LKRLKAKEEE	WREAQQGFNK	IWREQYEKAY
LKSLDHQAVN	FKQNDTKALR	SKSLLNEIES	VYDEHQEQHS	EGRSAPSSEP
HLIFVYEDRQ	ILEDAAALIS	YYVKRQPAIQ	KEDQGTIHQL	LHQFVPSLFF
SQQLDLGASE	ESADEDRDSP	QGQTTDPSER	KKPAPGPHSS	PPEEKGAFGD
APATEQPPLP	PPAPHKPLDD	VYSLFFANNN	WYFFLRLHQT	LCSRLLKIYR
QAQKQLLEYR	TEKEREKLLC	EGRREKGSDP	AMELRLKQPS	EVELEEYYPA
FLDMVRSLLE	GSIDPTQYED	TLREMFTIHA	YVGFTMDKLV	QNIARQLHHL
VSDDVCLKVV	ELYLNEKKRG	AAGGNLSSRC	VRAARETSYQ	WKAERCMADE
NCFKVMFLQR	KGQVIMTIEL	LDTEEAQTED	PVEVQHLARY	VEQYVGTEGA
SSSPTEGFLL	KPVFLQRNLK	KFRRRWQSEQ	ARALRGEARS	SWKRLVGVES
ACDVDCRFKL	STHKMVFIVN	SEDYMYRRGT	LCRAKQVQPL	VLLRHHQHFE
EWHSRWLEDN	VTVEAASLVQ	DWLMGEEDED	MVPCKTLCET	VHVHGLPVTR
YRVQYSRRPA	SP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
Lalioti V.S., Vergarajauregui S., Villasante A., Pulido D., Sandoval I.V. (2013). C6orf89 encodes three distinct HDAC enhancers that function in the nucleolus, the Golgi and the midbody. J. Cell. Physiol. 228: 1907—1921. PMID 23460338 DOI:10.1002/jcp.24355

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19354 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O75182 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.