SLFN11

Ідентифікатори

Символи

SLFN11, SLFN8/9, schlafen family member 11

Зовнішні ІД

OMIM: 614953 MGI: 2672859 HomoloGene: 89175 GeneCards: SLFN11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• tRNA binding • nucleotide binding • ATP binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATPase activity • GO:0008026 helicase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• aggresome • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • site of DNA damage • хромосома
Біологічний процес	• GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • defense response to virus • процес імунної системи • negative regulation of DNA replication • positive regulation of cell death • replication fork arrest • cellular response to DNA damage stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


91607


276950

Ensembl


ENSG00000172716


ENSMUSG00000035208

UniProt


Q7Z7L1


B1ARD8

RefSeq (мРНК)

NM_001104587 NM_001104588 NM_001104589 NM_001104590 NM_152270
NM_001376007 NM_001376008 NM_001376009 NM_001376010 NM_001376011 NM_001376012 NM_001387158 NM_001387159 NM_001387160 NM_001387161 NM_001387162 NM_001387163


NM_001167743 NM_181545

RefSeq (білок)

NP_001098057 NP_001098058 NP_001098059 NP_001098060 NP_689483
NP_001362936 NP_001362937 NP_001362938 NP_001362939 NP_001362940 NP_001362941


NP_001161215 NP_853523

Локус (UCSC)

Хр. 17: 35.35 – 35.37 Mb

Хр. 11: 82.89 – 82.91 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SLFN11 (англ. Schlafen family member 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 901 амінокислот, а молекулярна маса — 102 836^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEANQCPLVV	EPSYPDLVIN	VGEVTLGEEN	RKKLQKIQRD	QEKERVMRAA
CALLNSGGGV	IRMAKKVEHP	VEMGLDLEQS	LRELIQSSDL	QAFFETKQQG
RCFYIFVKSW	SSGPFPEDRS	VKPRLCSLSS	SLYRRSETSV	RSMDSREAFC
FLKTKRKPKI	LEEGPFHKIH	KGVYQELPNS	DPADPNSDPA	DLIFQKDYLE
YGEILPFPES	QLVEFKQFST	KHFQEYVKRT	IPEYVPAFAN	TGGGYLFIGV
DDKSREVLGC	AKENVDPDSL	RRKIEQAIYK	LPCVHFCQPQ	RPITFTLKIV
NVLKRGELYG	YACMIRVNPF	CCAVFSEAPN	SWIVEDKYVC	SLTTEKWVGM
MTDTDPDLLQ	LSEDFECQLS	LSSGPPLSRP	VYSKKGLEHK	KELQQLLFSV
PPGYLRYTPE	SLWRDLISEH	RGLEELINKQ	MQPFFRGILI	FSRSWAVDLN
LQEKPGVICD	ALLIAQNSTP	ILYTILREQD	AEGQDYCTRT	AFTLKQKLVN
MGGYTGKVCV	RAKVLCLSPE	SSAEALEAAV	SPMDYPASYS	LAGTQHMEAL
LQSLVIVLLG	FRSLLSDQLG	CEVLNLLTAQ	QYEIFSRSLR	KNRELFVHGL
PGSGKTIMAM	KIMEKIRNVF	HCEAHRILYV	CENQPLRNFI	SDRNICRAET
RKTFLRENFE	HIQHIVIDEA	QNFRTEDGDW	YGKAKSITRR	AKGGPGILWI
FLDYFQTSHL	DCSGLPPLSD	QYPREELTRI	VRNADPIAKY	LQKEMQVIRS
NPSFNIPTGC	LEVFPEAEWS	QGVQGTLRIK	KYLTVEQIMT	CVADTCRRFF
DRGYSPKDVA	VLVSTAKEVE	HYKYELLKAM	RKKRVVQLSD	ACDMLGDHIV
LDSVRRFSGL	ERSIVFGIHP	RTADPAILPN	VLICLASRAK	QHLYIFPWGG
H

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК, тРНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26633 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q7Z7L1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.