SMAD9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMAD9, MADH6, MADH9, PPH2, SMAD8, SMAD8A, SMAD8B, SMAD8/9, SMAD family member 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603295 MGI: 1859993 HomoloGene: 21198 GeneCards: SMAD9 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • SMAD protein complex • transcription regulator complex • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • SMAD protein signal transduction • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • hindbrain development • cellular response to BMP stimulus • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • protein phosphorylation • cartilage development • bone development • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • midbrain development • GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001127217 NM_005905 NM_001378621 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001120689 NP_005896 NP_001365550 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 13: 36.84 – 36.92 Mb | Хр. 3: 54.66 – 54.71 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMAD9 (англ. SMAD family member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 493[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHSTTPISSL | | FSFTSPAVKR | | LLGWKQGDEE | | EKWAEKAVDS | | LVKKLKKKKG |
AMDELERALS | | CPGQPSKCVT | | IPRSLDGRLQ | | VSHRKGLPHV | | IYCRVWRWPD |
LQSHHELKPL | | ECCEFPFGSK | | QKEVCINPYH | | YRRVETPVLP | | PVLVPRHSEY |
NPQLSLLAKF | | RSASLHSEPL | | MPHNATYPDS | | FQQPPCSALP | | PSPSHAFSQS |
PCTASYPHSP | | GSPSEPESPY | | QHSVDTPPLP | | YHATEASETQ | | SGQPVDATAD |
RHVVLSIPNG | | DFRPVCYEEP | | QHWCSVAYYE | | LNNRVGETFQ | | ASSRSVLIDG |
FTDPSNNRNR | | FCLGLLSNVN | | RNSTIENTRR | | HIGKGVHLYY | | VGGEVYAECV |
SDSSIFVQSR | | NCNYQHGFHP | | ATVCKIPSGC | | SLKVFNNQLF | | AQLLAQSVHH |
GFEVVYELTK | | MCTIRMSFVK | | GWGAEYHRQD | | VTSTPCWIEI | | HLHGPLQWLD |
KVLTQMGSPH | | NPISSVS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
- Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
- Wrana J.L., Attisano L. (2000). The Smad pathway. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 5—13. PMID 10708948 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00024-6
- Miyazono K. (2000). TGF-beta signaling by Smad proteins. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 15—22. PMID 10708949 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00025-8
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6774 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15198 (англ.) . Архів оригіналу за 17 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|