SNAPC2

Ідентифікатори

Символи

SNAPC2, PTFDELTA, SNAP45, small nuclear RNA activating complex polypeptide 2

Зовнішні ІД

OMIM: 605076 MGI: 1914861 HomoloGene: 2318 GeneCards: SNAPC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• snRNA transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • snRNA transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6618


102209

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000011837

UniProt


Q13487


Q91XA5

RefSeq (мРНК)


NM_003083


NM_133968

RefSeq (білок)


NP_003074


NP_598729

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 8: 4.3 – 4.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAPC2 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 35 556^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKPPPRRRAA	PARYLGEVTG	PATWSAREKR	QLVRLLQARQ	GQPEPDATEL
ARELRGRSEA	EIRVFLQQLK	GRVAREAIQK	VHPGGLQGPR	RREAQPPAPI
EVWTDLAEKI	TGPLEEALAV	AFSQVLTIAA	TEPVTLLHSK	PPKPTQARGK
PLLLSAPGGQ	EDPAPEIPSS	APAAPSSAPR	TPDPAPEKPS	ESSAGPSTEE
DFAVDFEKIY	KYLSSVSRSG	RSPELSAAES	AVVLDLLMSL	PEELPLLPCT
ALVEHMTETY	LRLTAPQPIP	AGGSLGPAAE	GDGAGSKAPE	ETPPATEKAE
HSELKSPWQA	AGICPLNPFL	VPLELLGRAA	TPAR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

Sadowski C.L., Henry R.W., Kobayashi R., Hernandez N. (1996). The SNAP45 subunit of the small nuclear RNA (snRNA) activating protein complex is required for RNA polymerase II and III snRNA gene transcription and interacts with the TATA box binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 4289—4293. PMID 8633057 DOI:10.1073/pnas.93.9.4289
Yoon J.B., Roeder R.G. (1996). Cloning of two proximal sequence element-binding transcription factor subunits (gamma and delta) that are required for transcription of small nuclear RNA genes by RNA polymerases II and III and interact with the TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 16: 1—9. PMID 8524284 DOI:10.1128/MCB.16.1.1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11135 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13487 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.