SNAPC5

Ідентифікатори

Символи

SNAPC5, SNAP19, small nuclear RNA activating complex polypeptide 5

Зовнішні ІД

OMIM: 605979 MGI: 1914282 HomoloGene: 4414 GeneCards: SNAPC5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase III promoter • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10302


330959

Ensembl


ENSG00000174446


ENSMUSG00000032398

UniProt


O75971


Q8R2K7

RefSeq (мРНК)


NM_001329613 NM_001329614 NM_001329615 NM_006049


NM_183316 NM_025925

RefSeq (білок)


NP_001316542 NP_001316543 NP_001316544 NP_006040


NP_899139

Локус (UCSC)

Хр. 15: 66.49 – 66.5 Mb

Хр. 9: 64.09 – 64.09 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAPC5 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 98 амінокислот, а молекулярна маса — 11 328^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSRLQELRK		EEETLLRLKA		ALHDQLNRLK		VEELALQSMI		SSRRGDEMLS
SHTVPEQSHD		MLVHVDNEAS		INQTTLELST		KSHVTEEEEE		EEEEESDS

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Henry R.W., Mittal V., Ma B., Kobayashi R., Hernandez N. (1998). SNAP19 mediates the assembly of a functional core promoter complex (SNAPc) shared by RNA polymerases II and III. Genes Dev. 12: 2664—2672. PMID 9732265 DOI:10.1101/gad.12.17.2664
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 DOI:10.1074/jbc.M009301200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15484 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O75971 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.