SNCAIP |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNCAIP, SYPH1, Sph1, synuclein alpha interacting protein |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603779 MGI: 1915097 HomoloGene: 3987 GeneCards: SNCAIP |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • neuronal cell body • presynaptic membrane • Синаптичні бульбашки • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule |
---|
Біологічний процес | • regulation of inclusion body assembly • dopamine metabolic process • смерть клітини • regulation of neurotransmitter secretion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001242935 NM_001308100 NM_001308105 NM_001308106 NM_001308107
| NM_001308108 NM_001308109 NM_005460 |
| | NM_001199151 NM_001199153 NM_001199154 NM_026408 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001229864 NP_001295029 NP_001295034 NP_001295035 NP_001295036
| NP_001295037 NP_001295038 NP_005451 |
| NP_001186080 NP_001186082 NP_001186083 NP_080684 NP_001390575
| NP_001390576 NP_001390577 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 122.31 – 122.46 Mb | Хр. 18: 52.9 – 53.05 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNCAIP (англ. Synuclein alpha interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 100 409[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEAPEYLDLD | | EIDFSDDISY | | SVTSLKTIPE | | LCRRCDTQNE | | DRSVSSSSWN |
CGISTLITNT | | QKPTGIADVY | | SKFRPVKRVS | | PLKHQPETLE | | NNESDDQKNQ |
KVVEYQKGGE | | SDLGPQPQEL | | GPGDGVGGPP | | GKSSEPSTSL | | GELEHYDLDM |
DEILDVPYIK | | SSQQLASFTK | | VTSEKRILGL | | CTTINGLSGK | | ACSTGSSESS |
SSNMAPFCVL | | SPVKSPHLRK | | ASAVIHDQHK | | LSTEETEISP | | PLVKCGSAYE |
PENQSKDFLN | | KTFSDPHGRK | | VEKTTPDCQL | | RAFHLQSSAA | | ESKPEEQVSG |
LNRTSSQGPE | | ERSEYLKKVK | | SILNIVKEGQ | | ISLLPHLAAD | | NLDKIHDENG |
NNLLHIAASQ | | GHAECLQHLT | | SLMGEDCLNE | | RNTEKLTPAG | | LAIKNGQLEC |
VRWMVSETEA | | IAELSCSKDF | | PSLIHYAGCY | | GQEKILLWLL | | QFMQEQGISL |
DEVDQDGNSA | | VHVASQHGYL | | GCIQTLVEYG | | ANVTMQNHAG | | EKPSQSAERQ |
GHTLCSRYLV | | VVETCMSLAS | | QVVKLTKQLK | | EQTVERVTLQ | | NQLQQFLEAQ |
KSEGKSLPSS | | PSSPSSPASR | | KSQWKSPDAD | | DDSVAKSKPG | | VQEGIQVLGS |
LSASSRARPK | | AKDEDSDKIL | | RQLLGKEISE | | NVCTQEKLSL | | EFQDAQASSR |
NSKKIPLEKR | | ELKLARLRQL | | MQRSLSESDT | | DSNNSEDPKT | | TPVRKADRPR |
PQPIVESVES | | MDSAESLHLM | | IKKHTLASGG | | RRFPFSIKAS | | KSLDGHSPSP |
TSESSEPDLE | | SQYPGSGSIP | | PNQPSGDPQQ | | PSPDSTAAQK | | VATSPKSALK |
SPSSKRRTSQ | | NLKLRVTFEE | | PVVQMEQPSL | | ELNGEKDKDK | | GRTLQRTSTS |
NESGDQLKRP | | FGAFRSIMET | | LSGNQNNNNN | | YQAANQLKTS | | TLPLTSLGRK |
TDAKGNPASS | | ASKGKNKAA |
Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Myhre R., Klungland H., Farrer M.J., Aasly J.O. (2008). Genetic association study of synphilin-1 in idiopathic Parkinson's disease. BMC Med. Genet. 9: 19—19. PMID 18366718 DOI:10.1186/1471-2350-9-19
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11139 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y6H5 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |