SNF8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2ZME, 3CUQ

Ідентифікатори

Символи

SNF8, Dot3, EAP30, VPS22, ESCRT-II complex subunit, SNF8 subunit of ESCRT-II

Зовнішні ІД

OMIM: 610904 MGI: 1343161 HomoloGene: 5239 GeneCards: SNF8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • protein N-terminus binding • transcription factor binding • protein C-terminus binding • channel regulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • transcription regulator complex • клітинна мембрана • нуклеоплазма • perinuclear region of cytoplasm • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро • ESCRT II complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • multivesicular body sorting pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multivesicular body assembly • regulation of multivesicular body size involved in endosome transport • transcription, DNA-templated • endosomal transport • regulation of protein complex stability • GO:1901313 positive regulation of gene expression • early endosome to late endosome transport • endocytic recycling • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • protein transport • regulation of MAP kinase activity • positive regulation of exosomal secretion • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • regulation of molecular function • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11267


27681

Ensembl


ENSG00000159210


ENSMUSG00000006058

UniProt


Q96H20


Q9CZ28

RefSeq (мРНК)


NM_007241 NM_001317192 NM_001317193 NM_001317194


NM_033568 NM_001356362

RefSeq (білок)


NP_001304121 NP_001304122 NP_001304123 NP_009172


NP_291046 NP_001343291

Локус (UCSC)

Хр. 17: 48.93 – 48.94 Mb

Хр. 11: 95.93 – 95.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNF8 (англ. SNF8, ESCRT-II complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 28 864^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHRRGVGAGA	IAKKKLAEAK	YKERGTVLAE	DQLAQMSKQL	DMFKTNLEEF
ASKHKQEIRK	NPEFRVQFQD	MCATIGVDPL	ASGKGFWSEM	LGVGDFYYEL
GVQIIEVCLA	LKHRNGGLIT	LEELHQQVLK	GRGKFAQDVS	QDDLIRAIKK
LKALGTGFGI	IPVGGTYLIQ	SVPAELNMDH	TVVLQLAEKN	GYVTVSEIKA
SLKWETERAR	QVLEHLLKEG	LAWLDLQAPG	EAHYWLPALF	TDLYSQEITA
EEAREALP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

Schmidt A.E., Miller T., Schmidt S.L., Shiekhattar R., Shilatifard A. (1999). Cloning and characterization of the EAP30 subunit of the ELL complex that confers derepression of transcription by RNA polymerase II. J. Biol. Chem. 274: 21981—21985. PMID 10419521 DOI:10.1074/jbc.274.31.21981
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Progida C., Spinosa M.R., De Luca A., Bucci C. (2006). RILP interacts with the VPS22 component of the ESCRT-II complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 347: 1074—1079. PMID 16857164 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.07.007
Wang T., Hong W. (2006). RILP interacts with VPS22 and VPS36 of ESCRT-II and regulates their membrane recruitment. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 413—423. PMID 17010938 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.064
Satoh J., Nanri Y., Yamamura T. (2006). Rapid identification of 14-3-3-binding proteins by protein microarray analysis. J. Neurosci. Methods. 152: 278—288. PMID 16260042 DOI:10.1016/j.jneumeth.2005.09.015

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17028 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96H20 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.