SNRPA1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A9N

Ідентифікатори

Символи

SNRPA1, Lea1, small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A', U2A'

Зовнішні ІД

OMIM: 603521 MGI: 1916231 HomoloGene: 2325 GeneCards: SNRPA1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• U2 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • small nuclear ribonucleoprotein complex • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • nuclear speck • ядерні тільця • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome • Нуклеокапсид
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • interleukin-12-mediated signaling pathway • Сперматогенез
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6627


68981

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000030512

UniProt


P09661


P57784

RefSeq (мРНК)


NM_003090


NM_021336

RefSeq (білок)


NP_003081


NP_067311

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 7: 65.71 – 65.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNRPA1 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A') – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 255 амінокислот, а молекулярна маса — 28 416^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVKLTAELIE	QAAQYTNAVR	DRELDLRGYK	IPVIENLGAT	LDQFDAIDFS
DNEIRKLDGF	PLLRRLKTLL	VNNNRICRIG	EGLDQALPCL	TELILTNNSL
VELGDLDPLA	SLKSLTYLSI	LRNPVTNKKH	YRLYVIYKVP	QVRVLDFQKV
KLKERQEAEK	MFKGKRGAQL	AKDIARRSKT	FNPGAGLPTD	KKKGGPSPGD
VEAIKNAIAN	ASTLAEVERL	KGLLQSGQIP	GRERRSGPTD	DGEEEMEEDT
VTNGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sillekens P.T.G., Beijer R.P., Habets W.J., van Venrooij W.J. (1989). Molecular cloning of the cDNA for the human U2 snRNA-specific A' protein. Nucleic Acids Res. 17: 1893—1906. PMID 2928112 DOI:10.1093/nar/17.5.1893
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
Eldridge A.G., Li Y., Sharp P.A., Blencowe B.J. (1999). The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6125—6130. PMID 10339552 DOI:10.1073/pnas.96.11.6125
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Price S.R., Evans P.R., Nagai K. (1998). Crystal structure of the spliceosomal U2B'-U2A' protein complex bound to a fragment of U2 small nuclear RNA. Nature. 394: 645—650. PMID 9716128 DOI:10.1038/29234

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11152 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, P09661 (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.