SNX1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2I4K, 4FZS

Ідентифікатори

Символи

SNX1, HsT17379, VPS5, sorting nexin 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601272 MGI: 1928395 HomoloGene: 99716 GeneCards: SNX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • insulin receptor binding • leptin receptor binding • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • transferrin receptor binding • lipid binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • early endosome membrane • мембрана • retromer, tubulation complex • внутрішньоклітинна мембранна органела • retromer complex • early endosome • endosome membrane • lamellipodium • extrinsic component of membrane • везикула • лізосома • ендосома • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle organization • early endosome to Golgi transport • receptor internalization • endosomal transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • intracellular protein transport • lamellipodium morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6642


56440

Ensembl


ENSG00000028528


ENSMUSG00000032382

UniProt


Q13596


Q9WV80

RefSeq (мРНК)


NM_001242933 NM_003099 NM_148955 NM_152826


NM_019727

RefSeq (білок)


NP_001229862 NP_003090 NP_683758


NP_062701

Локус (UCSC)

Хр. 15: 64.09 – 64.15 Mb

Хр. 9: 66 – 66.03 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX1 (англ. Sorting nexin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 070^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGGGGCSA	SERLPPPFPG	LEPESEGAAG	GSEPEAGDSD	TEGEDIFTGA
AVVSKHQSPK	ITTSLLPINN	GSKENGIHEE	QDQEPQDLFA	DATVELSLDS
TQNNQKKVLA	KTLISLPPQE	ATNSSKPQPT	YEELEEEEQE	DQFDLTVGIT
DPEKIGDGMN	AYVAYKVTTQ	TSLPLFRSKQ	FAVKRRFSDF	LGLYEKLSEK
HSQNGFIVPP	PPEKSLIGMT	KVKVGKEDSS	SAEFLEKRRA	ALERYLQRIV
NHPTMLQDPD	VREFLEKEEL	PRAVGTQTLS	GAGLLKMFNK	ATDAVSKMTI
KMNESDIWFE	EKLQEVECEE	QRLRKLHAVV	ETLVNHRKEL	ALNTAQFAKS
LAMLGSSEDN	TALSRALSQL	AEVEEKIEQL	HQEQANNDFF	LLAELLSDYI
RLLAIVRAAF	DQRMKTWQRW	QDAQATLQKK	REAEARLLWA	NKPDKLQQAK
DEILEWESRV	TQYERDFERI	STVVRKEVIR	FEKEKSKDFK	NHVIKYLETL
LYSQQQLAKY	WEAFLPEAKA	IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Kurten R.C., Cadena D.L., Gill G.N. (1996). Enhanced degradation of EGF receptors by a sorting nexin, SNX1. Science. 272: 1008—1010. PMID 8638121 DOI:10.1126/science.272.5264.1008
Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gullapalli A., Wolfe B.L., Griffin C.T., Magnuson T., Trejo J. (2006). An essential role for SNX1 in lysosomal sorting of protease-activated receptor-1: evidence for retromer-, Hrs-, and Tsg101-independent functions of sorting nexins. Mol. Biol. Cell. 17: 1228—1238. PMID 16407403 DOI:10.1091/mbc.E05-09-0899
Bujny M.V., Popoff V., Johannes L., Cullen P.J. (2007). The retromer component sorting nexin-1 is required for efficient retrograde transport of Shiga toxin from early endosome to the trans Golgi network. J. Cell Sci. 120: 2010—2021. PMID 17550970 DOI:10.1242/jcs.003111
Rojas R., Kametaka S., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2007). Interchangeable but essential functions of SNX1 and SNX2 in the association of retromer with endosomes and the trafficking of mannose 6-phosphate receptors. Mol. Cell. Biol. 27: 1112—1124. PMID 17101778 DOI:10.1128/MCB.00156-06

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11172 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13596 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.