SNX5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNX5, sorting nexin 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605937 MGI: 1916428 HomoloGene: 40944 GeneCards: SNX5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • dynactin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • protein heterodimerization activity • lipid binding • cadherin binding • phosphatidylinositol-5-phosphate binding • D1 dopamine receptor binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • cell projection • early endosome membrane • retromer, tubulation complex • мембрана • ruffle • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • extrinsic component of endosome membrane • tubular endosome • retromer complex • early endosome • phagocytic cup • cytoplasmic vesicle membrane • macropinocytic cup • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • brush border • внутрішньоклітинний |
---|
Біологічний процес | • ендоцитоз • vesicle organization • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • Піноцитоз • intracellular protein transport • regulation of macroautophagy • epidermal growth factor catabolic process • positive regulation of renal sodium excretion • negative regulation of blood pressure |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_152227 NM_001282454 NM_014426 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001269383 NP_055241 NP_689413 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 17.94 – 17.97 Mb | Хр. 2: 144.09 – 144.11 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNX5 (англ. Sorting nexin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 46 816[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAAVPELLQQ | | QEEDRSKLRS | | VSVDLNVDPS | | LQIDIPDALS | | ERDKVKFTVH |
TKTTLPTFQS | | PEFSVTRQHE | | DFVWLHDTLI | | ETTDYAGLII | | PPAPTKPDFD |
GPREKMQKLG | | EGEGSMTKEE | | FAKMKQELEA | | EYLAVFKKTV | | SSHEVFLQRL |
SSHPVLSKDR | | NFHVFLEYDQ | | DLSVRRKNTK | | EMFGGFFKSV | | VKSADEVLFT |
GVKEVDDFFE | | QEKNFLINYY | | NRIKDSCVKA | | DKMTRSHKNV | | ADDYIHTAAC |
LHSLALEEPT | | VIKKYLLKVA | | ELFEKLRKVE | | GRVSSDEDLK | | LTELLRYYML |
NIEAAKDLLY | | RRTKALIDYE | | NSNKALDKAR | | LKSKDVKLAE | | AHQQECCQKF |
EQLSESAKEE | | LINFKRKRVA | | AFRKNLIEMS | | ELEIKHARNN | | VSLLQSCIDL |
FKNN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.
Література
- Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lim J.P., Wang J.T., Kerr M.C., Teasdale R.D., Gleeson P.A. (2008). A role for SNX5 in the regulation of macropinocytosis. BMC Cell Biol. 9: 58—58. PMID 18854019 DOI:10.1186/1471-2121-9-58
- Sun Y., Hedman A.C., Tan X., Schill N.J., Anderson R.A. (2013). Endosomal type Igamma PIP 5-kinase controls EGF receptor lysosomal sorting. Dev. Cell. 25: 144—155. PMID 23602387 DOI:10.1016/j.devcel.2013.03.010
- Schill N.J., Hedman A.C., Choi S., Anderson R.A. (2014). Isoform 5 of PIPKIgamma regulates the endosomal trafficking and degradation of E-cadherin. J. Cell Sci. 127: 2189—2203. PMID 24610942 DOI:10.1242/jcs.132423
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14969 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5X3 (англ.) . Архів оригіналу за 14 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |