SOCS6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2VIF

Ідентифікатори

Символи

SOCS6, CIS-4, CIS4, HSPC060, SOCS-4, SOCS-6, SOCS4, SSI4, STAI4, STATI4, suppressor of cytokine signaling 6

Зовнішні ІД

OMIM: 605118 MGI: 1924885 HomoloGene: 3120 GeneCards: SOCS6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 1-phosphatidylinositol-3-kinase regulator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • immunological synapse • гіалоплазма • phosphatidylinositol 3-kinase complex
Біологічний процес	• regulation of growth • defense response • proteasomal protein catabolic process • receptor signaling pathway via JAK-STAT • negative regulation of signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • negative regulation of T cell activation • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • посттрансляційна модифікація • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9306


54607

Ensembl


ENSG00000170677


ENSMUSG00000056153

UniProt


O14544


Q9JLY0

RefSeq (мРНК)


NM_004232 NM_016387


NM_018821

RefSeq (білок)


NP_004223


NP_061291

Локус (UCSC)

Хр. 18: 70.29 – 70.33 Mb

Хр. 18: 88.68 – 88.95 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SOCS6 (англ. Suppressor of cytokine signaling 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 535 амінокислот, а молекулярна маса — 59 528^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKISLKTLR	KSFNLNKSKE	ETDFMVVQQP	SLASDFGKDD	SLFGSCYGKD
MASCDINGED	EKGGKNRSKS	ESLMGTLKRR	LSAKQKSKGK	AGTPSGSSAD
EDTFSSSSAP	IVFKDVRAQR	PIRSTSLRSH	HYSPAPWPLR	PTNSEETCIK
MEVRVKALVH	SSSPSPALNG	VRKDFHDLQS	ETTCQEQANS	LKSSASHNGD
LHLHLDEHVP	VVIGLMPQDY	IQYTVPLDEG	MYPLEGSRSY	CLDSSSPMEV
SAVPPQVGGR	AFPEDESQVD	QDLVVAPEIF	VDQSVNGLLI	GTTGVMLQSP
RAGHDDVPPL	SPLLPPMQNN	QIQRNFSGLT	GTEAHVAESM	RCHLNFDPNS
APGVARVYDS	VQSSGPMVVT	SLTEELKKLA	KQGWYWGPIT	RWEAEGKLAN
VPDGSFLVRD	SSDDRYLLSL	SFRSHGKTLH	TRIEHSNGRF	SFYEQPDVEG
HTSIVDLIEH	SIRDSENGAF	CYSRSRLPGS	ATYPVRLTNP	VSRFMQVRSL
QYLCRFVIRQ	YTRIDLIQKL	PLPNKMKDYL	QEKHY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, регуляція росту.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ronnstrand L. (2004). Signal transduction via the stem cell factor receptor/c-Kit. Cell. Mol. Life Sci. 61: 2535—2548. PMID 15526160 DOI:10.1007/s00018-004-4189-6

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16833 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O14544 (англ.) . Архів оригіналу за 9 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.