SPACA3 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SPACA3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4YF2

Ідентифікатори

Символи

SPACA3, 1700025M08Rik, ALLP17, CT54, LYC3, LYZL3, SLLP1, LYZC, sperm acrosome associated 3

Зовнішні ІД

OMIM: 612749 MGI: 1922872 HomoloGene: 18365 GeneCards: SPACA3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lysozyme activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • extracellular region • Акросома • secretory granule • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • acrosomal membrane • acrosomal matrix
Біологічний процес	• monocyte activation • cell wall macromolecule catabolic process • запліднення • positive regulation of phagocytosis • response to virus • positive regulation of macrophage activation • sperm-egg recognition • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • peptidoglycan catabolic process • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • fusion of sperm to egg plasma membrane involved in single fertilization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


124912


75622

Ensembl


ENSG00000141316


ENSMUSG00000053184

UniProt


Q8IXA5


Q9D9X8

RefSeq (мРНК)


NM_173847 NM_001317225 NM_001317226


NM_029367 NM_001359183

RefSeq (білок)


NP_001304154 NP_001304155 NP_776246


NP_083643 NP_001346112

Локус (UCSC)

Хр. 17: 32.97 – 33 Mb

Хр. 11: 80.75 – 80.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPACA3 (англ. Sperm acrosome associated 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 215 амінокислот, а молекулярна маса — 23 431^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVSALRGAPL	IRVHSSPVSS	PSVSGPRRLV	SCLSSQSSAL	SQSGGGSTSA
AGIEARSRAL	RRRWCPAGIM	LLALVCLLSC	LLPSSEAKLY	GRCELARVLH
DFGLDGYRGY	SLADWVCLAY	FTSGFNAAAL	DYEADGSTNN	GIFQINSRRW
CSNLTPNVPN	VCRMYCSDLL	NPNLKDTVIC	AMKITQEPQG	LGYWEAWRHH
CQGKDLTEWV	DGCDF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chiu W.W.C., Erikson E.K., Sole C.A., Shelling A.N., Chamley L.W. (2004). SPRASA, a novel sperm protein involved in immune-mediated infertility. Hum. Reprod. 19: 243—249. PMID 14747161 DOI:10.1093/humrep/deh050

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16260 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8IXA5 (англ.) . Архів оригіналу за 17 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.