SPECC1

Ідентифікатори

Символи

SPECC1, CYTSB, HCMOGT-1, HCMOGT1, NSP, sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1, NSP5

Зовнішні ІД

OMIM: 608793 MGI: 2442356 HomoloGene: 45157 GeneCards: SPECC1

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння^[1]

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


92521


432572

Ensembl


ENSG00000128487


ENSMUSG00000042331

UniProt


Q5M775


Q5SXY1

RefSeq (мРНК)

NM_001033553 NM_001033554 NM_001033555 NM_001243438 NM_001243439
NM_152904 NM_001386077 NM_001386078 NM_001386079 NM_001386080 NM_001386081 NM_001386082 NM_001386083 NM_001386084 NM_001386085


NM_001029936 NM_001281818 NM_001310526

RefSeq (білок)

NP_001028725 NP_001028726 NP_001028727 NP_001230367 NP_001230368
NP_690868


NP_001025107 NP_001268747 NP_001297455

Локус (UCSC)

Хр. 17: 20.01 – 20.32 Mb

Хр. 11: 61.85 – 62.11 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPECC1 (англ. Sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 118 585^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRSAAKPWNP	AIRAGGHGPD	RVRPLPAASS	GMKSSKSSTS	LAFESRLSRL
KRASSEDTLN	KPGSTAASGV	VRLKKTATAG	AISELTESRL	RSGTGAFTTT
KRTGIPAPRE	FSVTVSRERS	VPRGPSNPRK	SVSSPTSSNT	PTPTKHLRTP
STKPKQENEG	GEKAALESQV	RELLAEAKAK	DSEINRLRSE	LKKYKEKRTL
NAEGTDALGP	NVDGTSVSPG	DTEPMIRALE	EKNKNFQKEL	SDLEEENRVL
KEKLIYLEHS	PNSEGAASHT	GDSSCPTSIT	QESSFGSPTG	NQMSSDIDEY
KKNIHGNALR	TSGSSSSDVT	KASLSPDASD	FEHITAETPS	RPLSSTSNPF
KSSKCSTAGS	SPNSVSELSL	ASLTEKIQKM	EENHHSTAEE	LQATLQELSD
QQQMVQELTA	ENEKLVDEKT	ILETSFHQHR	ERAEQLSQEN	EKLMNLLQER
VKNEEPTTQE	GKIIELEQKC	TGILEQGRFE	REKLLNIQQQ	LTCSLRKVEE
ENQGALEMIK	RLKEENEKLN	EFLELERHNN	NMMAKTLEEC	RVTLEGLKME
NGSLKSHLQG	EKQKATEASA	VEQTAESCEV	QEMLKVARAE	KDLLELSCNE
LRQELLKANG	EIKHVSSLLA	KVEKDYSYLK	EICDHQAEQL	SRTSLKLQEK
ASESDAEIKD	MKETIFELED	QVEQHRAVKL	HNNQLISELE	SSVIKLEEQK
SDLERQLKTL	TKQMKEETEE	WRRFQADLQT	AVVVANDIKC	EAQQELRTVK
RKLLEEEEKN	ARLQKELGDV	QGHGRVVTSR	AAPPPVDEEP	ESSEVDAAGR
WPGVCVSRTS	PTPPESATTV	KSLIKSFDLG	RPGGAGQNIS	VHKTPRSPLS
GIPVRTAPAA	AVSPMQRHST	YSSVRPASRG	VTQRLDLPDL	PLSDILKGRT
ETLKPDPHLR	KSPSLESLSR	PPSLGFGDTR	LLSASTRAWK	PQSKLSVERK
DPLAALAREY	GGSKRNALLK	WCQKKTQGYA	NIDITNFSSS	WSDGLAFCAL
LHTYLPAHIP	YQELNSQEKK	RNLLLAFEAA	ESVGIKPSLE	LSEMLYTDRP
DWQSVMQYVA	QIYKYFET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

Sang N., Fath D.M., Giordano A. (2004). A gene highly expressed in tumor cells encodes novel structure proteins. Oncogene. 23: 9438—9446. PMID 15602574 DOI:10.1038/sj.onc.1207988
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPECC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30615 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5M775 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.