SPECC1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SPECC1, CYTSB, HCMOGT-1, HCMOGT1, NSP, sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1, NSP5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608793 MGI: 2442356 HomoloGene: 45157 GeneCards: SPECC1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001033553 NM_001033554 NM_001033555 NM_001243438 NM_001243439
| NM_152904 NM_001386077 NM_001386078 NM_001386079 NM_001386080 NM_001386081 NM_001386082 NM_001386083 NM_001386084 NM_001386085 |
| | NM_001029936 NM_001281818 NM_001310526 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001028725 NP_001028726 NP_001028727 NP_001230367 NP_001230368
| NP_690868 |
| | NP_001025107 NP_001268747 NP_001297455 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 20.01 – 20.32 Mb | Хр. 11: 61.85 – 62.11 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SPECC1 (англ. Sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 068 амінокислот, а молекулярна маса — 118 585[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRSAAKPWNP | | AIRAGGHGPD | | RVRPLPAASS | | GMKSSKSSTS | | LAFESRLSRL |
KRASSEDTLN | | KPGSTAASGV | | VRLKKTATAG | | AISELTESRL | | RSGTGAFTTT |
KRTGIPAPRE | | FSVTVSRERS | | VPRGPSNPRK | | SVSSPTSSNT | | PTPTKHLRTP |
STKPKQENEG | | GEKAALESQV | | RELLAEAKAK | | DSEINRLRSE | | LKKYKEKRTL |
NAEGTDALGP | | NVDGTSVSPG | | DTEPMIRALE | | EKNKNFQKEL | | SDLEEENRVL |
KEKLIYLEHS | | PNSEGAASHT | | GDSSCPTSIT | | QESSFGSPTG | | NQMSSDIDEY |
KKNIHGNALR | | TSGSSSSDVT | | KASLSPDASD | | FEHITAETPS | | RPLSSTSNPF |
KSSKCSTAGS | | SPNSVSELSL | | ASLTEKIQKM | | EENHHSTAEE | | LQATLQELSD |
QQQMVQELTA | | ENEKLVDEKT | | ILETSFHQHR | | ERAEQLSQEN | | EKLMNLLQER |
VKNEEPTTQE | | GKIIELEQKC | | TGILEQGRFE | | REKLLNIQQQ | | LTCSLRKVEE |
ENQGALEMIK | | RLKEENEKLN | | EFLELERHNN | | NMMAKTLEEC | | RVTLEGLKME |
NGSLKSHLQG | | EKQKATEASA | | VEQTAESCEV | | QEMLKVARAE | | KDLLELSCNE |
LRQELLKANG | | EIKHVSSLLA | | KVEKDYSYLK | | EICDHQAEQL | | SRTSLKLQEK |
ASESDAEIKD | | MKETIFELED | | QVEQHRAVKL | | HNNQLISELE | | SSVIKLEEQK |
SDLERQLKTL | | TKQMKEETEE | | WRRFQADLQT | | AVVVANDIKC | | EAQQELRTVK |
RKLLEEEEKN | | ARLQKELGDV | | QGHGRVVTSR | | AAPPPVDEEP | | ESSEVDAAGR |
WPGVCVSRTS | | PTPPESATTV | | KSLIKSFDLG | | RPGGAGQNIS | | VHKTPRSPLS |
GIPVRTAPAA | | AVSPMQRHST | | YSSVRPASRG | | VTQRLDLPDL | | PLSDILKGRT |
ETLKPDPHLR | | KSPSLESLSR | | PPSLGFGDTR | | LLSASTRAWK | | PQSKLSVERK |
DPLAALAREY | | GGSKRNALLK | | WCQKKTQGYA | | NIDITNFSSS | | WSDGLAFCAL |
LHTYLPAHIP | | YQELNSQEKK | | RNLLLAFEAA | | ESVGIKPSLE | | LSEMLYTDRP |
DWQSVMQYVA | | QIYKYFET |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані.
Література
- Sang N., Fath D.M., Giordano A. (2004). A gene highly expressed in tumor cells encodes novel structure proteins. Oncogene. 23: 9438—9446. PMID 15602574 DOI:10.1038/sj.onc.1207988
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з SPECC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30615 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5M775 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |